283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3766 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 
465 aa  960    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.12 
 
 
444 aa  242  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.15 
 
 
439 aa  241  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.43 
 
 
444 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.3 
 
 
445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.72 
 
 
445 aa  213  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.72 
 
 
439 aa  206  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.06 
 
 
443 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.75 
 
 
449 aa  202  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.97 
 
 
467 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.87 
 
 
443 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.72 
 
 
492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.03 
 
 
470 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  24.59 
 
 
472 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  26.89 
 
 
463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  26.45 
 
 
479 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  27.69 
 
 
511 aa  113  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  24.92 
 
 
457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  27.24 
 
 
478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  28.52 
 
 
466 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  25.96 
 
 
456 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  27.51 
 
 
464 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  24.59 
 
 
457 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  25.64 
 
 
456 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  25.64 
 
 
456 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  28.25 
 
 
465 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.48 
 
 
471 aa  98.6  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.5 
 
 
452 aa  98.2  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  27.97 
 
 
459 aa  97.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2299  hypothetical protein  25.11 
 
 
472 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  26.2 
 
 
445 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  42.31 
 
 
509 aa  94  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.23 
 
 
430 aa  93.2  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  27.34 
 
 
457 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  27.38 
 
 
453 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  26.75 
 
 
439 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  25.62 
 
 
441 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  26.32 
 
 
453 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  27.89 
 
 
453 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  27.08 
 
 
453 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  27.89 
 
 
453 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  27.08 
 
 
453 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  26.33 
 
 
439 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  27.89 
 
 
454 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  27.89 
 
 
454 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.39 
 
 
445 aa  83.2  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  26.77 
 
 
441 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  27.21 
 
 
418 aa  81.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  26.09 
 
 
439 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  26.25 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.07 
 
 
433 aa  77.8  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  27.42 
 
 
441 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01893  PmbA  27.08 
 
 
455 aa  77  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0485  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.31 
 
 
448 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0310  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.77 
 
 
446 aa  75.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0108287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  24.69 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  24.74 
 
 
464 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  25.12 
 
 
439 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.49 
 
 
479 aa  74.3  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.56 
 
 
450 aa  73.2  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.11 
 
 
455 aa  73.2  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  22.01 
 
 
449 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  26.01 
 
 
453 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.2 
 
 
457 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.82 
 
 
448 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.334504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  27.36 
 
 
441 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  22.14 
 
 
449 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.26 
 
 
465 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  24.82 
 
 
452 aa  68.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.06 
 
 
465 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.89 
 
 
463 aa  69.3  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  22.74 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0996  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.56 
 
 
427 aa  68.2  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.100891 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0211  pmbA protein  22.76 
 
 
447 aa  67.8  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.64 
 
 
445 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  22.67 
 
 
444 aa  67.8  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.61 
 
 
435 aa  67.4  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0191  pmbA protein  22.76 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.12 
 
 
445 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  24.8 
 
 
453 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.65 
 
 
465 aa  66.6  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2079  microcin-processing peptidase 1  23.58 
 
 
485 aa  66.6  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  23.08 
 
 
446 aa  66.6  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  23.19 
 
 
447 aa  66.6  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.23 
 
 
468 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10471  putative modulator of DNA gyrase  28.79 
 
 
462 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0348305  hitchhiker  0.00321513 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  22.94 
 
 
450 aa  65.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1785  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.57 
 
 
442 aa  64.7  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179483  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0365  putative modulator of DNA gyrase  28.79 
 
 
462 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0414  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.37 
 
 
455 aa  64.7  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.273882  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.8 
 
 
435 aa  64.3  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0971  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.21 
 
 
469 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0235752  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3042  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.79 
 
 
456 aa  64.3  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0474  PmbA protein  25.37 
 
 
455 aa  64.3  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.184246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2764  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.45 
 
 
446 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.08 
 
 
435 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1053  microcin-processing peptidase 1  23.21 
 
 
486 aa  64.3  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0903  PmbA/TldD related protein  23.95 
 
 
448 aa  63.9  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.28 
 
 
446 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1475  DNA gyrase modulator peptidase U62  27.54 
 
 
453 aa  63.9  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>