88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0408 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  902    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  90.48 
 
 		 441 aa  827    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  69.11 
 
 		 445 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  65.3 
 
 		 439 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  64.6 
 
 		 439 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  64.61 
 
 		 443 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  64.37 
 
 		 439 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  61 
 
 		 441 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  61.09 
 
 		 441 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  57.37 
 
 		 439 aa  490  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  58.05 
 
 		 439 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  47.03 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  49.05 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  49.05 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  49.05 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  49.05 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  49.05 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  49.05 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  49.05 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  46.81 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  45.66 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  42.66 
 
 		 444 aa  334  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  43.34 
 
 		 418 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  38.81 
 
 		 448 aa  296  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  39.95 
 
 		 447 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4122  putative Zn-dependent protease  37.44 
 
 		 447 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4162  Zn-dependent protease  37.44 
 
 		 447 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  34.01 
 
 		 444 aa  274  2.0000000000000002e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  36.55 
 
 		 454 aa  256  6e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.84 
 
 		 439 aa  99  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.99 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.77 
 
 		 465 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.27 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.85 
 
 		 467 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.58 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.19 
 
 		 445 aa  67  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.45 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.35 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.84 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.01 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  25.89 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.96 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  25.95 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  36.36 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0062  Zn-dependent protease-like protein  24.44 
 
 		 620 aa  56.6  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.54 
 
 		 449 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  28.5 
 
 		 479 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  35.35 
 
 		 457 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  28.19 
 
 		 464 aa  53.5  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  26.21 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  35.62 
 
 		 511 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  35.06 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  28.37 
 
 		 472 aa  51.6  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  35.06 
 
 		 456 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  35.06 
 
 		 456 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  30 
 
 		 446 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  30 
 
 		 446 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30 
 
 		 450 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  30 
 
 		 450 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  30 
 
 		 450 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  30 
 
 		 446 aa  50.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  30 
 
 		 450 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  30 
 
 		 446 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  28.57 
 
 		 463 aa  50.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  29.41 
 
 		 450 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.1 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  27.78 
 
 		 466 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  29.17 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0421  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.89 
 
 		 448 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  30.95 
 
 		 446 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4551  pmbA protein  24.8 
 
 		 453 aa  47.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4720  peptidase PmbA  30.95 
 
 		 446 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  30.95 
 
 		 446 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  30.95 
 
 		 446 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  30.95 
 
 		 446 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.16 
 
 		 435 aa  47  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.68 
 
 		 492 aa  47  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  25.82 
 
 		 447 aa  47  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3042  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.65 
 
 		 456 aa  47  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  33.33 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.11 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.334504 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2122  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.58 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000158093  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0903  PmbA/TldD related protein  24.41 
 
 		 448 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  27.43 
 
 		 447 aa  43.9  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  28.22 
 
 		 434 aa  43.9  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3821  peptidase PmbA  26.75 
 
 		 446 aa  43.1  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.26 
 
 		 426 aa  43.1  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0492  peptidase PmbA  29.52 
 
 		 447 aa  43.1  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.855998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>