56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0754 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  913    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4162  Zn-dependent protease  42.79 
 
 		 447 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4122  putative Zn-dependent protease  42.79 
 
 		 447 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  44.15 
 
 		 447 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  42.99 
 
 		 448 aa  327  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  39.65 
 
 		 444 aa  327  4.0000000000000003e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  42.03 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  39.69 
 
 		 439 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  38.73 
 
 		 445 aa  279  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  37.19 
 
 		 453 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  37.64 
 
 		 453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  38.43 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  38.43 
 
 		 439 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  38.2 
 
 		 439 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  37.86 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  37.86 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  38.74 
 
 		 441 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  37.64 
 
 		 453 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  37.64 
 
 		 453 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  38.48 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  37.64 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  37.64 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  37.24 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  38.8 
 
 		 441 aa  259  6e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  36.55 
 
 		 441 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  37.86 
 
 		 453 aa  256  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  36.89 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  36.3 
 
 		 444 aa  242  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  35.2 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.8 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.31 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0062  Zn-dependent protease-like protein  25.86 
 
 		 620 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.25 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.11 
 
 		 465 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.58 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.88 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.53 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.18 
 
 		 439 aa  53.5  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.12 
 
 		 445 aa  53.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.59 
 
 		 467 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  30.28 
 
 		 459 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.86 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0313  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.65 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.73 
 
 		 445 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.33 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.23 
 
 		 470 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1208  TldD/PmbA family protein  32.77 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.99051  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.39 
 
 		 471 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  20.75 
 
 		 448 aa  47.4  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1014  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.34 
 
 		 438 aa  47  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00863088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1808  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.69 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39064  normal  0.563323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  30.77 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  33.82 
 
 		 509 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  29.03 
 
 		 463 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  29.27 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.93 
 
 		 438 aa  43.1  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>