65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4823 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  99.54 
 
 		 439 aa  882    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  92.48 
 
 		 439 aa  823    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  87.44 
 
 		 443 aa  778    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  889    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  64.76 
 
 		 445 aa  568  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  65.52 
 
 		 441 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  64.37 
 
 		 441 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  62.56 
 
 		 441 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  62.1 
 
 		 441 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  56.85 
 
 		 439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  54.57 
 
 		 439 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  45.75 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  45.85 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  44.83 
 
 		 453 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  44.83 
 
 		 454 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  44.83 
 
 		 454 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  44.83 
 
 		 453 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  44.83 
 
 		 453 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  44.83 
 
 		 453 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  44.83 
 
 		 453 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  43.91 
 
 		 453 aa  349  6e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  46.08 
 
 		 444 aa  342  7e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  42.82 
 
 		 447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  40.22 
 
 		 448 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  42.45 
 
 		 418 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4162  Zn-dependent protease  39.29 
 
 		 447 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4122  putative Zn-dependent protease  39.06 
 
 		 447 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  34.92 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  38.2 
 
 		 454 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.74 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.09 
 
 		 465 aa  80.1  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.23 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.6 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.84 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.89 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.38 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.07 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  26.38 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.38 
 
 		 445 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0402  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.7 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  29.27 
 
 		 479 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.45 
 
 		 443 aa  53.5  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.39 
 
 		 470 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25 
 
 		 445 aa  51.2  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0996  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  20.75 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.100891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.97 
 
 		 449 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.84 
 
 		 435 aa  49.3  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  36.14 
 
 		 457 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2122  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.55 
 
 		 409 aa  47.4  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000158093  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  20.15 
 
 		 444 aa  47  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1208  TldD/PmbA family protein  23.35 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.99051  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  36.36 
 
 		 511 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0062  Zn-dependent protease-like protein  24.43 
 
 		 620 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  33.77 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  36.36 
 
 		 509 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  36.36 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  39.62 
 
 		 457 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3042  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.63 
 
 		 456 aa  45.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.81 
 
 		 448 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.334504 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.88 
 
 		 457 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0485  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.94 
 
 		 448 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  26.39 
 
 		 446 aa  43.9  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0421  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.06 
 
 		 448 aa  43.9  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.26 
 
 		 448 aa  43.5  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.35 
 
 		 471 aa  43.1  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>