67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4996 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  75.5 
 
 
454 aa  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  75.5 
 
 
454 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  75.5 
 
 
453 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  100 
 
 
453 aa  909    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  75.5 
 
 
453 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  75.72 
 
 
453 aa  677    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  75.5 
 
 
453 aa  654    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  75.5 
 
 
453 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  65.78 
 
 
453 aa  618  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  66.67 
 
 
453 aa  616  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  48.23 
 
 
441 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  46.43 
 
 
445 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  46.81 
 
 
441 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  47.25 
 
 
441 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  47.25 
 
 
441 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  44.6 
 
 
443 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  45.52 
 
 
439 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  46.03 
 
 
439 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  44.29 
 
 
439 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  45 
 
 
439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  44.72 
 
 
439 aa  339  5.9999999999999996e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  42.7 
 
 
444 aa  325  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  41.57 
 
 
418 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  35.75 
 
 
444 aa  299  8e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4122  putative Zn-dependent protease  36.58 
 
 
447 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4162  Zn-dependent protease  36.58 
 
 
447 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  34.4 
 
 
448 aa  277  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  37.86 
 
 
454 aa  262  8e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  36.34 
 
 
447 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27 
 
 
444 aa  104  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.18 
 
 
443 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.35 
 
 
439 aa  94  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.8 
 
 
445 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.73 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.53 
 
 
439 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25 
 
 
465 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.91 
 
 
444 aa  73.2  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.92 
 
 
467 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.5 
 
 
470 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.69 
 
 
449 aa  64.3  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25 
 
 
443 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0062  Zn-dependent protease-like protein  25.97 
 
 
620 aa  61.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  27.11 
 
 
457 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  27.11 
 
 
457 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  32.17 
 
 
456 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  32.17 
 
 
456 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  32.17 
 
 
456 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.85 
 
 
471 aa  57  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  36.99 
 
 
463 aa  53.5  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25 
 
 
433 aa  53.1  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  24.94 
 
 
472 aa  53.1  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  27.35 
 
 
479 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  27.76 
 
 
478 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  30.59 
 
 
511 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.05 
 
 
445 aa  49.3  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  35.82 
 
 
464 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.06 
 
 
448 aa  49.3  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  33.01 
 
 
459 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.68 
 
 
492 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.11 
 
 
447 aa  47.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.67 
 
 
452 aa  47.8  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.12 
 
 
479 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  27.62 
 
 
466 aa  44.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.13 
 
 
436 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.05 
 
 
438 aa  44.3  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  32.56 
 
 
457 aa  43.5  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25 
 
 
445 aa  43.1  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>