60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2405 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  917    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4122  putative Zn-dependent protease  41.06 
 
 		 447 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4162  Zn-dependent protease  41.28 
 
 		 447 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  40.32 
 
 		 448 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  39.68 
 
 		 447 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  39.65 
 
 		 454 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  36.45 
 
 		 445 aa  299  8e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  34.39 
 
 		 453 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  35.15 
 
 		 439 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  35.37 
 
 		 439 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  34.92 
 
 		 439 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  35.75 
 
 		 453 aa  289  8e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  33.94 
 
 		 453 aa  289  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  34.39 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  34.39 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  35.36 
 
 		 441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  34.01 
 
 		 443 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  34.16 
 
 		 453 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  34.16 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  34.16 
 
 		 453 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  34.16 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  34.15 
 
 		 441 aa  279  6e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  33.18 
 
 		 453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  34.01 
 
 		 441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  32.81 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  32.58 
 
 		 441 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  32.73 
 
 		 439 aa  259  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  28.6 
 
 		 444 aa  239  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  31.1 
 
 		 418 aa  229  9e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.49 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.62 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.1 
 
 		 449 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.52 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.91 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.73 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0062  Zn-dependent protease-like protein  25 
 
 		 620 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.7 
 
 		 443 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.74 
 
 		 465 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.27 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  21.2 
 
 		 459 aa  55.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0549  pmbA protein  22.41 
 
 		 457 aa  53.5  0.000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.83 
 
 		 433 aa  53.5  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  20.83 
 
 		 457 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.15 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  21.96 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  20.5 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  20.5 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  20.5 
 
 		 456 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.91 
 
 		 447 aa  50.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  21.1 
 
 		 457 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1292  TldD/PmbA family protein  28.48 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00918646  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.45 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.64 
 
 		 448 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.334504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0485  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.01 
 
 		 448 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.98 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0996  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.38 
 
 		 427 aa  47  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.100891 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.49 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  20.93 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.33 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.07 
 
 		 470 aa  43.9  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>