74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2189 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  900    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  49.58 
 
 		 472 aa  415  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  51.84 
 
 		 466 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  50.54 
 
 		 478 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  47.81 
 
 		 479 aa  383  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  49.14 
 
 		 463 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  50.43 
 
 		 465 aa  364  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  46.25 
 
 		 509 aa  360  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2299  hypothetical protein  46.57 
 
 		 472 aa  352  8.999999999999999e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  44.06 
 
 		 457 aa  342  9e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  45.53 
 
 		 464 aa  342  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.69 
 
 		 471 aa  335  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  43.5 
 
 		 457 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  41.39 
 
 		 457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  43.2 
 
 		 456 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  52.31 
 
 		 511 aa  306  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  42.76 
 
 		 456 aa  306  7e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  42.76 
 
 		 456 aa  306  7e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.6 
 
 		 439 aa  176  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.63 
 
 		 445 aa  173  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.51 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.4 
 
 		 445 aa  170  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.98 
 
 		 444 aa  167  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.15 
 
 		 444 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.57 
 
 		 443 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.02 
 
 		 465 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.62 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.86 
 
 		 470 aa  93.6  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.63 
 
 		 445 aa  93.6  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.88 
 
 		 467 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.22 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.8 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.91 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  26.13 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  27.09 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  28.73 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  28.11 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  26.69 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  28.38 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  25.94 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  26.22 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  27.66 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  31.85 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  29.32 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  29.61 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  21.29 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.34 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  26.22 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  26.92 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  26.22 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  26.89 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  26.89 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  26.89 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  25.79 
 
 		 454 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  26.89 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  25.82 
 
 		 447 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  29.64 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  29.77 
 
 		 439 aa  51.6  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5204  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.78 
 
 		 427 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000020169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  23.17 
 
 		 448 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0402  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.38 
 
 		 405 aa  50.4  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0996  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.48 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.100891 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  26.57 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0779  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.76 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2122  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.05 
 
 		 409 aa  48.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000158093  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.74 
 
 		 438 aa  47.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  26.38 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4162  Zn-dependent protease  23.57 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1808  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.93 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39064  normal  0.563323 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.2 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.31 
 
 		 448 aa  44.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12740  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  34.04 
 
 		 448 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2179  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.78 
 
 		 427 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4122  putative Zn-dependent protease  29.79 
 
 		 447 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>