69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3428 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  74.84 
 
 
457 aa  666    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  79.87 
 
 
457 aa  698    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  99.34 
 
 
456 aa  892    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  78.56 
 
 
457 aa  683    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  900    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  900    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  51.29 
 
 
463 aa  421  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  51.29 
 
 
478 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  51.17 
 
 
465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  49.56 
 
 
479 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  50.87 
 
 
466 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  48.83 
 
 
472 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.79 
 
 
471 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  49.09 
 
 
509 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  47.15 
 
 
464 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2299  hypothetical protein  47.76 
 
 
472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  59.19 
 
 
511 aa  343  4e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  41.68 
 
 
459 aa  302  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.54 
 
 
445 aa  187  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.69 
 
 
443 aa  178  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.1 
 
 
439 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.7 
 
 
445 aa  170  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.14 
 
 
444 aa  167  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.26 
 
 
449 aa  166  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.31 
 
 
444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.38 
 
 
443 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.68 
 
 
465 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.69 
 
 
439 aa  91.3  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.94 
 
 
470 aa  83.6  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.77 
 
 
492 aa  79.7  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.33 
 
 
467 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  29.67 
 
 
418 aa  64.7  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  29.95 
 
 
453 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  26.89 
 
 
439 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  25.89 
 
 
441 aa  57  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  28.99 
 
 
444 aa  57  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  25.63 
 
 
448 aa  56.6  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  32.17 
 
 
453 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  27.8 
 
 
445 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.36 
 
 
433 aa  54.7  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  34.94 
 
 
439 aa  53.1  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  36.11 
 
 
441 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  27.27 
 
 
443 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  29.44 
 
 
453 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  37.5 
 
 
441 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  29.44 
 
 
453 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  29.44 
 
 
454 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  29.44 
 
 
453 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  23.89 
 
 
453 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  29.44 
 
 
453 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  29.44 
 
 
454 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.32 
 
 
452 aa  52.4  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  35.11 
 
 
441 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  20.5 
 
 
444 aa  51.6  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.74 
 
 
430 aa  50.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  19.53 
 
 
436 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  27.43 
 
 
453 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2161  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.43 
 
 
356 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2179  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.62 
 
 
427 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2241  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.62 
 
 
427 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.4 
 
 
445 aa  46.6  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0779  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.38 
 
 
436 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5204  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.07 
 
 
427 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000020169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  37.74 
 
 
439 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.47 
 
 
438 aa  44.3  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1937  DNA gyrase modulator peptidase U62  24.89 
 
 
437 aa  44.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.227653  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  35.85 
 
 
439 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0062  Zn-dependent protease-like protein  23.56 
 
 
620 aa  43.5  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1014  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.7 
 
 
438 aa  43.1  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00863088  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>