74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0515 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  87.67 
 
 		 439 aa  780    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  88.58 
 
 		 439 aa  783    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  900    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  87.44 
 
 		 439 aa  778    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  65.69 
 
 		 445 aa  585  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  65.53 
 
 		 441 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  64.61 
 
 		 441 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  64.38 
 
 		 441 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  63.7 
 
 		 441 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  58.62 
 
 		 439 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  55.71 
 
 		 439 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  46.8 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  46.21 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  46.12 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  46.44 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  46.44 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  46.21 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  46.21 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  46.21 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  46.21 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  44.6 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  46.21 
 
 		 444 aa  343  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  40.45 
 
 		 448 aa  325  7e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4122  putative Zn-dependent protease  40.55 
 
 		 447 aa  315  9e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4162  Zn-dependent protease  40.55 
 
 		 447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  41 
 
 		 447 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  42.21 
 
 		 418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  34.01 
 
 		 444 aa  283  6.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  38.48 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.4 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.91 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.63 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.25 
 
 		 465 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.89 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.1 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.57 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.93 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.55 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.27 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  28.57 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  26.87 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.09 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  28.86 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.39 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.82 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  27.56 
 
 		 457 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  29 
 
 		 511 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.06 
 
 		 471 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  27.47 
 
 		 478 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  26.79 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  25.22 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  25.22 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  39.39 
 
 		 509 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  35.14 
 
 		 463 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  32.48 
 
 		 464 aa  50.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2122  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.83 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000158093  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.75 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0996  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.58 
 
 		 427 aa  47.4  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.100891 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  25.23 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.26 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.25 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.382298  normal  0.100895 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.27 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.32 
 
 		 448 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.334504 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1146  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.57 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1208  TldD/PmbA family protein  26.12 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.99051  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.7 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0549  pmbA protein  22.3 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0916  microcin-processing peptidase 1  27.59 
 
 		 447 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0214325  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0911  microcin-processing peptidase 1  29.29 
 
 		 460 aa  43.9  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  26.61 
 
 		 457 aa  43.5  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0421  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.81 
 
 		 448 aa  43.5  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  26.96 
 
 		 466 aa  43.5  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.26 
 
 		 448 aa  43.1  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3042  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.12 
 
 		 456 aa  43.1  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>