66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1367 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  966    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  63.3 
 
 		 465 aa  545  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  58.96 
 
 		 478 aa  531  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  60.38 
 
 		 466 aa  531  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  55.15 
 
 		 472 aa  495  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  55.43 
 
 		 463 aa  486  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  56.2 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  52.53 
 
 		 509 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2299  hypothetical protein  52.25 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  50.99 
 
 		 511 aa  430  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  52.01 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  47.64 
 
 		 457 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  47.74 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  49.25 
 
 		 456 aa  395  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.31 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  47.71 
 
 		 456 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  47.71 
 
 		 456 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  46.37 
 
 		 459 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.09 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30 
 
 		 445 aa  216  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.31 
 
 		 439 aa  193  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.38 
 
 		 444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.64 
 
 		 444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.75 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.57 
 
 		 449 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.54 
 
 		 443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.45 
 
 		 465 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.22 
 
 		 439 aa  96.3  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.14 
 
 		 467 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.9 
 
 		 470 aa  83.6  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.53 
 
 		 492 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  27.68 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  28.85 
 
 		 453 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  27.53 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  28.23 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  27.56 
 
 		 447 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  28.57 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  30.77 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  29.67 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  29.41 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  26.92 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  30 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  26.93 
 
 		 445 aa  57  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  28.5 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  29.27 
 
 		 439 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  28.37 
 
 		 453 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  28.37 
 
 		 453 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  28.17 
 
 		 439 aa  54.7  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  28.37 
 
 		 454 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  28.37 
 
 		 454 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  28.37 
 
 		 453 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  28.37 
 
 		 453 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  30.14 
 
 		 444 aa  53.9  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.17 
 
 		 433 aa  53.5  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.11 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.4 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4162  Zn-dependent protease  26.24 
 
 		 447 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  27.14 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5204  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.39 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000020169 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4122  putative Zn-dependent protease  26.59 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  25.35 
 
 		 453 aa  48.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.55 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.39 
 
 		 448 aa  46.6  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  33.87 
 
 		 453 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.64 
 
 		 438 aa  43.9  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.61 
 
 		 435 aa  43.5  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.566954 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>