109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1453 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  94.26 
 
 		 453 aa  869    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  916    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  65.56 
 
 		 453 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  66.67 
 
 		 453 aa  610  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  65.34 
 
 		 453 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  65.34 
 
 		 453 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  65.34 
 
 		 454 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  65.34 
 
 		 453 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  65.34 
 
 		 453 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  65.34 
 
 		 454 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  48.53 
 
 		 445 aa  408  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  47.03 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  47.7 
 
 		 439 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  46.12 
 
 		 443 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  46.08 
 
 		 439 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  45.66 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  45.85 
 
 		 439 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  47.95 
 
 		 441 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  46.8 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  45.8 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  44.72 
 
 		 439 aa  353  5e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  43.48 
 
 		 444 aa  348  9e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  40.1 
 
 		 418 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4162  Zn-dependent protease  38 
 
 		 447 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4122  putative Zn-dependent protease  37.76 
 
 		 447 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  37.89 
 
 		 447 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  35.55 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  33.18 
 
 		 444 aa  282  8.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  36.89 
 
 		 454 aa  269  8e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.17 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.64 
 
 		 439 aa  98.2  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.81 
 
 		 445 aa  96.7  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.01 
 
 		 443 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.45 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.01 
 
 		 465 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.74 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.06 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.37 
 
 		 470 aa  77  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.06 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.28 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.97 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.87 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  25.65 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0062  Zn-dependent protease-like protein  26.58 
 
 		 620 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  28.91 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  29.44 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.63 
 
 		 471 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.27 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.47 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  28.17 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.75 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  24.45 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  24.91 
 
 		 464 aa  56.6  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.46 
 
 		 492 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  26.46 
 
 		 463 aa  55.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  24.09 
 
 		 456 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  24.09 
 
 		 456 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  24.34 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0485  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.63 
 
 		 448 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.36 
 
 		 456 aa  53.9  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  24.72 
 
 		 511 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  27.68 
 
 		 466 aa  53.5  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  26.07 
 
 		 479 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1385  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.47 
 
 		 469 aa  53.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000808939  normal  0.0131442 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0996  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.64 
 
 		 427 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.100891 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.02 
 
 		 448 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.334504 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4534  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.53 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.333963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.38 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.28 
 
 		 468 aa  51.6  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.23 
 
 		 435 aa  50.8  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  34.21 
 
 		 509 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.23 
 
 		 435 aa  51.2  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.82 
 
 		 453 aa  49.7  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.43 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2122  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.35 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000158093  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2323  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.49 
 
 		 469 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118827  normal  0.680287 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0971  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.59 
 
 		 469 aa  48.5  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0235752  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1053  microcin-processing peptidase 1  28.51 
 
 		 486 aa  47.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0512  putative modulator of DNA gyrase  27.81 
 
 		 490 aa  47  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0421  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.98 
 
 		 448 aa  47  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0903  PmbA/TldD related protein  23.08 
 
 		 448 aa  46.6  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.34 
 
 		 465 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2079  microcin-processing peptidase 1  29.07 
 
 		 485 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.21 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3042  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.57 
 
 		 456 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  27.63 
 
 		 481 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.29 
 
 		 481 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4551  pmbA protein  26.03 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  23.94 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1487  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.86 
 
 		 486 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.71 
 
 		 486 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.01 
 
 		 508 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1785  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.4 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179483  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  30.07 
 
 		 486 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3287  microcin-processing peptidase 1  27.95 
 
 		 476 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  24.34 
 
 		 457 aa  44.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3646  microcin-processing peptidase 2  28.48 
 
 		 486 aa  43.9  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  27.96 
 
 		 465 aa  44.3  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30 
 
 		 486 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>