272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0621 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 
443 aa  909    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.69 
 
 
445 aa  303  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.26 
 
 
449 aa  296  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.28 
 
 
439 aa  294  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.59 
 
 
445 aa  289  6e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.93 
 
 
444 aa  276  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.78 
 
 
444 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.08 
 
 
443 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.06 
 
 
465 aa  205  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.89 
 
 
439 aa  196  8.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.32 
 
 
467 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  28.76 
 
 
457 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  27.91 
 
 
466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  26.54 
 
 
479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  29.41 
 
 
456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  26.81 
 
 
457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  28.25 
 
 
463 aa  127  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  29.07 
 
 
511 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  29.08 
 
 
456 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  29.08 
 
 
456 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  29.07 
 
 
465 aa  123  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  25.36 
 
 
457 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.65 
 
 
471 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  25.27 
 
 
478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.96 
 
 
470 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  28.8 
 
 
464 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  27.33 
 
 
472 aa  111  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.84 
 
 
492 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.38 
 
 
479 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  26.37 
 
 
452 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  24.55 
 
 
509 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  25 
 
 
447 aa  95.9  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1169  peptidase PmbA  25.28 
 
 
446 aa  94  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0355671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2299  hypothetical protein  26.15 
 
 
472 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  26.54 
 
 
453 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.2 
 
 
463 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0426  peptidase PmbA  25.06 
 
 
446 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  25.37 
 
 
453 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0490  peptidase PmbA  25.06 
 
 
446 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0267  peptidase PmbA  24.57 
 
 
446 aa  90.9  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  27.1 
 
 
441 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1385  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.07 
 
 
469 aa  90.5  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000808939  normal  0.0131442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1146  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.15 
 
 
454 aa  89.7  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0275  peptidase PmbA  24.6 
 
 
446 aa  89.7  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  23.7 
 
 
446 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  25.06 
 
 
432 aa  89  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  25 
 
 
453 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3663  peptidase PmbA  23.76 
 
 
446 aa  87  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  24.22 
 
 
447 aa  87  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  20.51 
 
 
433 aa  86.7  8e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  22.31 
 
 
464 aa  86.7  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  24.73 
 
 
446 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.54 
 
 
441 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0961  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.64 
 
 
456 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713767  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0957  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.64 
 
 
456 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  24.73 
 
 
446 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  24.73 
 
 
446 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  24.83 
 
 
450 aa  85.5  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4720  peptidase PmbA  24.73 
 
 
446 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  24.5 
 
 
450 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  24.12 
 
 
450 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.5 
 
 
450 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  24.5 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4195  microcin-processing peptidase 1  25.41 
 
 
456 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.03 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  24.73 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1040  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.41 
 
 
456 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0602  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.41 
 
 
456 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  24.5 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1081  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.41 
 
 
456 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  24.5 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  24.5 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  24.71 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  23.89 
 
 
450 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  26.77 
 
 
459 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  23.89 
 
 
450 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.45 
 
 
456 aa  83.2  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.55 
 
 
446 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  23.2 
 
 
444 aa  82.8  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  22.94 
 
 
439 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2692  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.6 
 
 
425 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3287  microcin-processing peptidase 1  24.09 
 
 
476 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3821  peptidase PmbA  23.63 
 
 
446 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.38 
 
 
448 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  24.14 
 
 
453 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  24.14 
 
 
453 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4261  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.89 
 
 
481 aa  81.6  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23 
 
 
445 aa  81.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2222  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.31 
 
 
470 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  23.41 
 
 
448 aa  80.9  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.47 
 
 
447 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2532  pmbA protein  23.9 
 
 
456 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0905  pmbA protein  23.9 
 
 
456 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  26.01 
 
 
453 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2844  TldD/PmbA family protein  23.9 
 
 
456 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  25.26 
 
 
454 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.96 
 
 
465 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  25.26 
 
 
453 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0242  pmbA protein  23.9 
 
 
456 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  25.26 
 
 
454 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>