72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5317 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 471 aa  927    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  52.89 
 
 		 478 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  52.68 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  50.97 
 
 		 472 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  52.06 
 
 		 463 aa  434  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  52.92 
 
 		 464 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  50.64 
 
 		 465 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  50.66 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  50.65 
 
 		 457 aa  411  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  51.08 
 
 		 457 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  48.9 
 
 		 509 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  47.42 
 
 		 479 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  50 
 
 		 456 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2299  hypothetical protein  48.63 
 
 		 472 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  48.5 
 
 		 456 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  48.5 
 
 		 456 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  54.7 
 
 		 511 aa  341  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  46 
 
 		 459 aa  323  4e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.97 
 
 		 439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.09 
 
 		 445 aa  183  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.65 
 
 		 444 aa  183  7e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.13 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.68 
 
 		 449 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.39 
 
 		 444 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.93 
 
 		 443 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.29 
 
 		 443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.27 
 
 		 465 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.74 
 
 		 470 aa  97.1  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.77 
 
 		 467 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.11 
 
 		 492 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.7 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.43 
 
 		 445 aa  76.6  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.49 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  29.22 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  26.61 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  26.91 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  24.64 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  27.35 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  28.57 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  29.82 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  27.69 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  27.69 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  27.69 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  27.69 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  27.69 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  27.69 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  28.29 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  26.02 
 
 		 445 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  29.85 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  30.42 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  27.73 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  28.57 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0313  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.87 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  29.06 
 
 		 443 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.26 
 
 		 426 aa  51.2  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  26.16 
 
 		 439 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.94 
 
 		 448 aa  51.2  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  25.61 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  28.63 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  27.39 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.89 
 
 		 435 aa  48.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4727  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.29 
 
 		 431 aa  46.6  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  27.8 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1937  DNA gyrase modulator peptidase U62  23.57 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.227653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2241  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.42 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2179  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.42 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.95 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  22.33 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1808  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.14 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39064  normal  0.563323 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2161  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.39 
 
 		 356 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.42 
 
 		 435 aa  43.9  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0779  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.69 
 
 		 436 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>