More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4727 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4727  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 431 aa  883    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1937  DNA gyrase modulator peptidase U62  64.66 
 
 		 437 aa  586  1e-166  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.227653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5204  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.31 
 
 		 427 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000020169 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0779  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  59.41 
 
 		 436 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2179  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  53.63 
 
 		 427 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2241  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  53.86 
 
 		 427 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2161  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  62.36 
 
 		 356 aa  481  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1589  putative modulator of DNA gyrase  49.65 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.880571 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_467  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.35 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0502  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.03 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.350832  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0526  pmbA/tldD family protein  32.58 
 
 		 433 aa  230  4e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.13 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0553  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.02 
 
 		 437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1014  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.07 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00863088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.11 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.06 
 
 		 445 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.07 
 
 		 435 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.01 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.62 
 
 		 447 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  26.3 
 
 		 444 aa  111  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3530  PmbA/TldD family protein  28.54 
 
 		 436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  26.39 
 
 		 460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.12 
 
 		 457 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.33 
 
 		 438 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0776  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.28 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.58521  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.13 
 
 		 450 aa  104  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.207758  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.25 
 
 		 462 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2575  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.65 
 
 		 447 aa  103  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336858 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0352  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.16 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.678191  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.34 
 
 		 448 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.66 
 
 		 436 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0916  microcin-processing peptidase 1  31.19 
 
 		 447 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0214325  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.16 
 
 		 435 aa  101  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  26.78 
 
 		 449 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.88 
 
 		 482 aa  100  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  27.12 
 
 		 449 aa  99.8  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.54 
 
 		 465 aa  99.4  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  25.16 
 
 		 473 aa  99  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0903  PmbA/TldD related protein  24.73 
 
 		 448 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09221  putative modulator of DNA gyrase; TldD  22.68 
 
 		 481 aa  97.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227286 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.44 
 
 		 435 aa  96.7  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  24.77 
 
 		 460 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  23.46 
 
 		 447 aa  95.9  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.72 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3681  protease TldD  30.42 
 
 		 481 aa  95.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  24.94 
 
 		 467 aa  95.5  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  28.1 
 
 		 481 aa  94  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.06 
 
 		 497 aa  93.6  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0978  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.9 
 
 		 427 aa  93.6  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0215485  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.22 
 
 		 443 aa  93.6  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0719088  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0294  microcin-processing peptidase 1  29.96 
 
 		 448 aa  93.2  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0485  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.6 
 
 		 448 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  30.43 
 
 		 479 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  28.57 
 
 		 490 aa  92.8  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.04 
 
 		 460 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.21 
 
 		 470 aa  92.8  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.43 
 
 		 479 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.43 
 
 		 479 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.43 
 
 		 479 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.43 
 
 		 479 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2337  microcin-processing peptidase 2  25.62 
 
 		 473 aa  92.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.652541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09191  putative modulator of DNA gyrase; TldD  22.15 
 
 		 474 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.507824  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  30.95 
 
 		 483 aa  92.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2236  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.23 
 
 		 471 aa  92.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0328346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4551  pmbA protein  23.66 
 
 		 453 aa  92.4  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  30.43 
 
 		 479 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1210  TldD/PmbA family protein  26.26 
 
 		 440 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.09 
 
 		 448 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.92 
 
 		 480 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0845  microcin-processing peptidase 2  30.43 
 
 		 480 aa  92  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  28.09 
 
 		 448 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  23.39 
 
 		 460 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1208  TldD/PmbA family protein  28.64 
 
 		 443 aa  91.7  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.99051  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.37 
 
 		 448 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.334504 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.05 
 
 		 469 aa  91.3  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  27.39 
 
 		 481 aa  91.3  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2687  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.28 
 
 		 450 aa  91.3  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.74 
 
 		 441 aa  90.9  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  27.39 
 
 		 481 aa  91.3  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  27.39 
 
 		 481 aa  91.3  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0639  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.49 
 
 		 453 aa  90.9  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.99 
 
 		 482 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.99 
 
 		 482 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.99 
 
 		 482 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0064  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.71 
 
 		 448 aa  90.1  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.669376  hitchhiker  0.000186098 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.38 
 
 		 441 aa  90.1  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3327  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.76 
 
 		 482 aa  90.1  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1327  antibiotic maturation factor  28.11 
 
 		 450 aa  90.1  7e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  30.43 
 
 		 481 aa  89.7  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.5 
 
 		 493 aa  89.7  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.44 
 
 		 468 aa  89.7  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1482  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.24 
 
 		 442 aa  89.4  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528913  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.99 
 
 		 482 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0876014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1309  putative modulator of DNA gyrase; TldD  22.65 
 
 		 469 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.102122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.32 
 
 		 479 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0474  TldD protein  29.03 
 
 		 482 aa  89  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.36 
 
 		 480 aa  89.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.502377 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  30.43 
 
 		 481 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  29.3 
 
 		 464 aa  89  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  29.95 
 
 		 481 aa  89  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>