More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5204 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5204  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 
427 aa  876    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000020169 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2241  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  69.09 
 
 
427 aa  635    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2179  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  69.32 
 
 
427 aa  638    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1937  DNA gyrase modulator peptidase U62  61.59 
 
 
437 aa  541  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.227653  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0779  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  61.18 
 
 
436 aa  511  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4727  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  58.31 
 
 
431 aa  508  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1589  putative modulator of DNA gyrase  54.25 
 
 
429 aa  456  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.880571 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2161  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.89 
 
 
356 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_467  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.19 
 
 
433 aa  243  6e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0526  pmbA/tldD family protein  36.26 
 
 
433 aa  242  1e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0502  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.17 
 
 
433 aa  236  6e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.350832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.57 
 
 
436 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0553  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.21 
 
 
437 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1014  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.89 
 
 
438 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00863088  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0903  PmbA/TldD related protein  26.28 
 
 
448 aa  127  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.45 
 
 
462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.08 
 
 
435 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2687  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.84 
 
 
450 aa  119  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4551  pmbA protein  27.9 
 
 
453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0485  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.7 
 
 
448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.73 
 
 
435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.63 
 
 
435 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0211  pmbA protein  25.62 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  31.27 
 
 
473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0191  pmbA protein  25.62 
 
 
447 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.06 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.76 
 
 
448 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.334504 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2575  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.13 
 
 
447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.336858 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.72 
 
 
457 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0916  microcin-processing peptidase 1  30 
 
 
447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0214325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  23.73 
 
 
446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0064  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.06 
 
 
448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.669376  hitchhiker  0.000186098 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.29 
 
 
436 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3042  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.28 
 
 
456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  25.36 
 
 
467 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.56 
 
 
445 aa  110  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.14 
 
 
468 aa  109  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1208  TldD/PmbA family protein  30.8 
 
 
443 aa  110  7.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.99051  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.61 
 
 
465 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0434  microcin-processing peptidase 1  25.3 
 
 
445 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  31.48 
 
 
444 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.98 
 
 
435 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.24 
 
 
462 aa  108  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.8 
 
 
448 aa  108  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  26.49 
 
 
452 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  27.3 
 
 
449 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.22 
 
 
463 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.382298  normal  0.100895 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  30.91 
 
 
460 aa  106  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.1 
 
 
469 aa  105  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  27.27 
 
 
449 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  26.8 
 
 
464 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.17 
 
 
470 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0639  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.22 
 
 
453 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0403  microcin-processing peptidase 1  31.22 
 
 
449 aa  104  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0481166  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.83 
 
 
446 aa  104  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3530  PmbA/TldD family protein  25.23 
 
 
436 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314475  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  24.94 
 
 
460 aa  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  29.46 
 
 
452 aa  103  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.74 
 
 
460 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.43 
 
 
445 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24 
 
 
450 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.53 
 
 
460 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0978  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.63 
 
 
427 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0215485  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  27.94 
 
 
448 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.94 
 
 
448 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.14 
 
 
483 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1482  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.74 
 
 
442 aa  100  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528913  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  30.8 
 
 
460 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.35 
 
 
438 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27 
 
 
430 aa  100  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0421  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.46 
 
 
448 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.76 
 
 
441 aa  100  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.72 
 
 
465 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.82 
 
 
465 aa  99.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.19 
 
 
465 aa  99.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.82 
 
 
479 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.94 
 
 
446 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1735  hypothetical protein  28.33 
 
 
452 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1735  hypothetical protein  28.33 
 
 
452 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  24.44 
 
 
447 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0352  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.28 
 
 
452 aa  98.2  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.678191  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1327  antibiotic maturation factor  24.84 
 
 
450 aa  98.2  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0403  TldD/PmbA family protein  29.87 
 
 
472 aa  97.4  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0599  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.54 
 
 
471 aa  97.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722035  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.71 
 
 
475 aa  97.1  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0294  microcin-processing peptidase 1  28.18 
 
 
448 aa  96.7  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2836  PmbA protein  26.49 
 
 
455 aa  95.9  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442501  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  31.94 
 
 
434 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1145  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.88 
 
 
420 aa  95.5  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.41 
 
 
497 aa  95.5  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.57 
 
 
453 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12740  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  28.51 
 
 
448 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0505  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.94 
 
 
471 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0640  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.6 
 
 
471 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.481365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2754  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.17 
 
 
489 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.7 
 
 
465 aa  94.7  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.15 
 
 
460 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2887  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.09 
 
 
468 aa  94.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1210  TldD/PmbA family protein  25.41 
 
 
440 aa  94.4  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2361  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.64 
 
 
448 aa  94.4  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>