79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2733 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  79.87 
 
 
456 aa  686    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  79.87 
 
 
456 aa  686    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  83.81 
 
 
457 aa  743    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  69.37 
 
 
457 aa  634    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  908    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  80.53 
 
 
456 aa  702    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  51.84 
 
 
478 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  51.51 
 
 
463 aa  421  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  53.08 
 
 
465 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  52.06 
 
 
466 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  51.08 
 
 
471 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  48.28 
 
 
479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  47.53 
 
 
472 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  48.17 
 
 
509 aa  388  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2299  hypothetical protein  49.36 
 
 
472 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  49.66 
 
 
464 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  57.86 
 
 
511 aa  345  8.999999999999999e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  43.5 
 
 
459 aa  315  8e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.72 
 
 
439 aa  183  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.48 
 
 
445 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.3 
 
 
449 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.25 
 
 
444 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.97 
 
 
443 aa  166  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.24 
 
 
445 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.57 
 
 
444 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.25 
 
 
443 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.24 
 
 
465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.46 
 
 
439 aa  86.7  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.12 
 
 
467 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.09 
 
 
470 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  50 
 
 
492 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  27.23 
 
 
441 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  27.82 
 
 
453 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  28.51 
 
 
441 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  25.29 
 
 
445 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  29.55 
 
 
443 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.97 
 
 
433 aa  59.7  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  26.34 
 
 
448 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  27.53 
 
 
453 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  26.82 
 
 
418 aa  57  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  27.44 
 
 
453 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  24.69 
 
 
439 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  27.44 
 
 
453 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  27.44 
 
 
453 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  27.44 
 
 
453 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  24.72 
 
 
453 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  27.44 
 
 
454 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  34.31 
 
 
439 aa  54.3  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  27.44 
 
 
454 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  28.64 
 
 
441 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0779  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.87 
 
 
436 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.89 
 
 
435 aa  53.5  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  28 
 
 
441 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.79 
 
 
430 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.16 
 
 
445 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  27.44 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.18 
 
 
445 aa  51.2  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.82 
 
 
452 aa  50.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  21.1 
 
 
444 aa  50.4  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2179  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.78 
 
 
427 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2161  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.15 
 
 
356 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2241  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.78 
 
 
427 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  27.88 
 
 
439 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5204  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.21 
 
 
427 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000020169 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  21.25 
 
 
449 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  21.67 
 
 
449 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  20.18 
 
 
436 aa  47.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  25.47 
 
 
453 aa  47  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  27.4 
 
 
439 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0526  pmbA/tldD family protein  24.42 
 
 
433 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0277  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.82 
 
 
442 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00851915  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.19 
 
 
446 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0062  Zn-dependent protease-like protein  25 
 
 
620 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  24.88 
 
 
447 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1937  DNA gyrase modulator peptidase U62  23.14 
 
 
437 aa  44.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.227653  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  24.14 
 
 
444 aa  44.3  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_467  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.11 
 
 
433 aa  43.9  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0502  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.11 
 
 
433 aa  43.5  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.350832  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  23.93 
 
 
446 aa  43.5  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>