69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0288 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  997    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  69.04 
 
 		 511 aa  635    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  57.37 
 
 		 478 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  56.59 
 
 		 466 aa  482  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  53.13 
 
 		 479 aa  477  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  57.26 
 
 		 465 aa  473  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2299  hypothetical protein  53.89 
 
 		 472 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  52.6 
 
 		 472 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  52.12 
 
 		 463 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  50.71 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.39 
 
 		 471 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  51.72 
 
 		 457 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  48.58 
 
 		 457 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  47.07 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  49.49 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  48.57 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  48.57 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  45.21 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.86 
 
 		 445 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.44 
 
 		 445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.92 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.98 
 
 		 444 aa  172  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.4 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.48 
 
 		 449 aa  162  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.49 
 
 		 443 aa  156  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.98 
 
 		 465 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.71 
 
 		 467 aa  110  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.23 
 
 		 439 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.95 
 
 		 443 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.34 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.09 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.6 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  26.72 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.91 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  24.72 
 
 		 445 aa  57  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.37 
 
 		 452 aa  54.7  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  28.28 
 
 		 441 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  27.53 
 
 		 443 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  20.23 
 
 		 433 aa  53.5  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  24.59 
 
 		 441 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  26.8 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  27.15 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2179  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.26 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  34.21 
 
 		 453 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  25.51 
 
 		 441 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  26.57 
 
 		 447 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  25.09 
 
 		 418 aa  50.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2241  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.29 
 
 		 427 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0779  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.32 
 
 		 436 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  25.97 
 
 		 439 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  37.31 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1937  DNA gyrase modulator peptidase U62  24.05 
 
 		 437 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.227653  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  25.19 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  25.93 
 
 		 444 aa  49.3  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  26.22 
 
 		 439 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  25.65 
 
 		 439 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  34.38 
 
 		 439 aa  47.4  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4162  Zn-dependent protease  26.64 
 
 		 447 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  23.43 
 
 		 453 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  33.82 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  24.81 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  24.81 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  24.81 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  24.81 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  24.81 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  24.81 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  24.49 
 
 		 445 aa  44.7  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  0.000000000000258626 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  21.28 
 
 		 449 aa  44.3  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4122  putative Zn-dependent protease  27.39 
 
 		 447 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>