More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1845 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1845  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 
428 aa  865    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.1559 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1292  TldD/PmbA family protein  36.56 
 
 
435 aa  291  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00918646  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0572  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.07 
 
 
446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4388  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.02 
 
 
446 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3721  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.3 
 
 
459 aa  103  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000190523  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  20.5 
 
 
446 aa  100  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01893  PmbA  20.32 
 
 
455 aa  99.8  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2232  microcin-processing peptidase 1  20.8 
 
 
446 aa  99.8  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.352601  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3740  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.97 
 
 
460 aa  99  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1014  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.29 
 
 
438 aa  98.2  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00863088  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0533  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  20.99 
 
 
461 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.86 
 
 
457 aa  97.8  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0512  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  20.3 
 
 
461 aa  96.7  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  19.19 
 
 
452 aa  96.7  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0538  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  20.74 
 
 
447 aa  96.3  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3805  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  20.74 
 
 
461 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0495  microcin-processing peptidase 1  21.34 
 
 
447 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1589  putative modulator of DNA gyrase  22.15 
 
 
429 aa  94.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.880571 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0594  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  20.6 
 
 
447 aa  95.5  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3067  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.51 
 
 
447 aa  94.7  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3455  microcin-processing peptidase 1  24.33 
 
 
447 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2415  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  20.99 
 
 
452 aa  94.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0416  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.28 
 
 
446 aa  94  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.9 
 
 
435 aa  94  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4078  pmba protein  20.84 
 
 
447 aa  94  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.89 
 
 
450 aa  94  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.16 
 
 
439 aa  93.6  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3631  microcin-processing peptidase 1  22.52 
 
 
447 aa  93.6  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.09 
 
 
443 aa  92.8  9e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0719088  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  22.54 
 
 
434 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.83 
 
 
441 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.57 
 
 
435 aa  91.3  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  21.96 
 
 
446 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  21.96 
 
 
446 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  21.96 
 
 
446 aa  90.9  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  21.96 
 
 
446 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.5 
 
 
435 aa  90.9  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0553  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.33 
 
 
437 aa  90.9  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.96 
 
 
450 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  19.51 
 
 
447 aa  90.5  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0492  peptidase PmbA  20.65 
 
 
447 aa  90.1  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.855998  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0482  PmbA protein  21.69 
 
 
453 aa  90.5  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  21.73 
 
 
450 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0502  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.19 
 
 
433 aa  90.1  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.350832  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  19.27 
 
 
455 aa  89.7  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  21.96 
 
 
450 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4551  pmbA protein  20.96 
 
 
453 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  21.96 
 
 
450 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2687  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.31 
 
 
450 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2133  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  18.02 
 
 
448 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.48 
 
 
435 aa  89  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  21.87 
 
 
450 aa  89  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  21.34 
 
 
447 aa  88.2  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  38.22 
 
 
444 aa  87  5e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0526  pmbA/tldD family protein  29.82 
 
 
433 aa  87  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0474  PmbA protein  19.39 
 
 
455 aa  86.7  8e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.184246  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  21.73 
 
 
450 aa  86.3  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.61 
 
 
436 aa  85.5  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0426  peptidase PmbA  19.91 
 
 
446 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0490  peptidase PmbA  19.91 
 
 
446 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  19.55 
 
 
432 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  20.79 
 
 
447 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1327  antibiotic maturation factor  24.11 
 
 
450 aa  84.7  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0414  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  19.39 
 
 
455 aa  84  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.273882  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.92 
 
 
441 aa  84  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1132  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.51 
 
 
441 aa  83.2  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0798905  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_467  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.9 
 
 
433 aa  83.2  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  20.28 
 
 
446 aa  83.2  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.96 
 
 
468 aa  82.4  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5204  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.27 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000020169 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  20.66 
 
 
447 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  20.79 
 
 
446 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  20.79 
 
 
446 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1169  peptidase PmbA  19.91 
 
 
446 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0355671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  20.79 
 
 
446 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  19.1 
 
 
473 aa  81.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  32.63 
 
 
449 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  32.11 
 
 
449 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21 
 
 
453 aa  81.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3663  peptidase PmbA  20.51 
 
 
446 aa  80.9  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  18.65 
 
 
444 aa  80.5  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3821  peptidase PmbA  22.3 
 
 
446 aa  80.5  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4720  peptidase PmbA  21.18 
 
 
446 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  20 
 
 
460 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0267  peptidase PmbA  20.14 
 
 
446 aa  80.5  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  17.63 
 
 
448 aa  80.1  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  21.4 
 
 
446 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0044  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.1 
 
 
442 aa  79.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0064  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  20.99 
 
 
448 aa  79.7  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.669376  hitchhiker  0.000186098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1487  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.56 
 
 
486 aa  79  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0978  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.11 
 
 
427 aa  79  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0215485  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.66 
 
 
450 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.207758  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4463  pmbA protein  19.44 
 
 
448 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0853906  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1129  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.33 
 
 
481 aa  77  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00884663  normal  0.442465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2161  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.26 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  20.99 
 
 
447 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.45 
 
 
430 aa  76.6  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.55 
 
 
479 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.18 
 
 
445 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0865  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  20.05 
 
 
448 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.619374  normal  0.968432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>