More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0779 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0779  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase  100 
 
 		 430 aa  884    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0996671  unclonable  0.000000000000263997 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.79 
 
 		 435 aa  305  9.000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0978  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.15 
 
 		 427 aa  287  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0215485  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.03 
 
 		 430 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2692  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.32 
 
 		 425 aa  279  6e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.07 
 
 		 436 aa  209  7e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.51 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.207758  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3530  PmbA/TldD family protein  30.96 
 
 		 436 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.84 
 
 		 445 aa  159  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0502  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.79 
 
 		 433 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.350832  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_467  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.67 
 
 		 433 aa  152  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0526  pmbA/tldD family protein  27.36 
 
 		 433 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.75 
 
 		 462 aa  143  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.95 
 
 		 450 aa  141  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1493  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.9 
 
 		 420 aa  140  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1145  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.15 
 
 		 420 aa  141  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0773  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.43 
 
 		 435 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.38 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.05 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0050  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.61 
 
 		 420 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.27 
 
 		 435 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  30.02 
 
 		 446 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0650  pmbA protein  27.38 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.501682  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.81 
 
 		 447 aa  127  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0838  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.34 
 
 		 420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.77 
 
 		 435 aa  127  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.73 
 
 		 457 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0390  microcin-processing peptidase 1  27.96 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.248859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.7 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.48 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.79 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  30.29 
 
 		 464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0553  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.06 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.61 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.29 
 
 		 465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  28.26 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.21 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.38 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.07 
 
 		 463 aa  110  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.1 
 
 		 446 aa  110  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  27.59 
 
 		 452 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0044  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.72 
 
 		 442 aa  108  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.19 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.43 
 
 		 444 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0352  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.12 
 
 		 452 aa  103  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.678191  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.45 
 
 		 438 aa  103  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  26.52 
 
 		 447 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2179  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.47 
 
 		 427 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0776  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.63 
 
 		 437 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.58521  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1030  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.42 
 
 		 442 aa  99.4  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  26.13 
 
 		 447 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2241  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.47 
 
 		 427 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.97 
 
 		 453 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0310  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.12 
 
 		 446 aa  98.2  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108287 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.83 
 
 		 441 aa  97.4  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  26.24 
 
 		 447 aa  97.4  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  26.06 
 
 		 450 aa  95.5  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.82 
 
 		 468 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1482  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.81 
 
 		 442 aa  95.1  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528913  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  27.19 
 
 		 473 aa  93.6  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0482  PmbA protein  27.17 
 
 		 453 aa  92.8  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  29.05 
 
 		 444 aa  91.7  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.82 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0294  microcin-processing peptidase 1  26.1 
 
 		 448 aa  91.3  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5204  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.83 
 
 		 427 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000020169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0426  peptidase PmbA  26.83 
 
 		 446 aa  90.9  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0490  peptidase PmbA  26.83 
 
 		 446 aa  90.9  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1785  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.48 
 
 		 442 aa  90.5  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179483  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1169  peptidase PmbA  27.23 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0355671 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1014  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.65 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00863088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2687  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.6 
 
 		 450 aa  88.6  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  26.77 
 
 		 449 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0916  microcin-processing peptidase 1  26.55 
 
 		 447 aa  87.8  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0214325  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1146  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25 
 
 		 454 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  25.46 
 
 		 450 aa  87  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  25.46 
 
 		 450 aa  87  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  25.46 
 
 		 446 aa  87  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  25.46 
 
 		 446 aa  87  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  25.46 
 
 		 446 aa  87  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  30.81 
 
 		 460 aa  87.4  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  25.46 
 
 		 446 aa  87  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.46 
 
 		 450 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  29.73 
 
 		 446 aa  86.3  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  25.93 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2361  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.37 
 
 		 448 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  25.93 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1937  DNA gyrase modulator peptidase U62  24.6 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.227653  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  25.93 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0064  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.94 
 
 		 448 aa  85.9  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.669376  hitchhiker  0.000186098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  25.69 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06836  peptidase  23.92 
 
 		 447 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2575  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.8 
 
 		 447 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336858 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  25.46 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4534  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.53 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.333963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0403  microcin-processing peptidase 1  27.56 
 
 		 449 aa  85.5  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0275  peptidase PmbA  26.06 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0492  peptidase PmbA  24.83 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.855998  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  26.79 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0639  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.34 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.79 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0158404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>