280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3510 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  72.26 
 
 
483 aa  734    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  72.26 
 
 
483 aa  734    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  69.38 
 
 
481 aa  679    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  72.26 
 
 
483 aa  734    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  72.26 
 
 
483 aa  734    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  72.26 
 
 
483 aa  734    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  80.33 
 
 
483 aa  815    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  80.54 
 
 
483 aa  814    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  72.26 
 
 
483 aa  734    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  69.58 
 
 
481 aa  683    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  85.86 
 
 
488 aa  866    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  86.48 
 
 
488 aa  870    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  100 
 
 
483 aa  990    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  72.26 
 
 
483 aa  734    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  73.29 
 
 
483 aa  740    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  72.26 
 
 
483 aa  734    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  91.3 
 
 
483 aa  915    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  56.62 
 
 
469 aa  560  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  43.48 
 
 
482 aa  428  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  41.92 
 
 
485 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  36.17 
 
 
501 aa  300  4e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.66 
 
 
513 aa  293  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  38.95 
 
 
478 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.16 
 
 
525 aa  280  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  35.1 
 
 
507 aa  279  8e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  34.95 
 
 
496 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  35 
 
 
505 aa  264  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.81 
 
 
514 aa  260  5.0000000000000005e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  34.38 
 
 
481 aa  252  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1685  altronate oxidoreductase  77.5 
 
 
80 aa  143  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00119512  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  27 
 
 
496 aa  139  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32.62 
 
 
387 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  30.37 
 
 
430 aa  133  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  28.27 
 
 
455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.56 
 
 
386 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.5 
 
 
386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  31.55 
 
 
387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.55 
 
 
387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.54 
 
 
493 aa  128  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  28.03 
 
 
464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.41 
 
 
373 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30 
 
 
378 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  27.16 
 
 
492 aa  123  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  24.82 
 
 
490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.52 
 
 
383 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3970  mannitol dehydrogenase-like  25.65 
 
 
473 aa  120  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  29.95 
 
 
505 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  26.82 
 
 
499 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  25.41 
 
 
489 aa  118  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  24.38 
 
 
488 aa  118  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2069  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.77 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  26.92 
 
 
478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  25.47 
 
 
451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0730  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  28.99 
 
 
470 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  30.45 
 
 
378 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  24.9 
 
 
488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  24.9 
 
 
488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.9 
 
 
488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  29.18 
 
 
510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  29.18 
 
 
386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  24.9 
 
 
488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.9 
 
 
488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  25.2 
 
 
488 aa  114  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0788  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.36 
 
 
486 aa  113  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3238  Mannitol dehydrogenase domain  27.83 
 
 
470 aa  114  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.794946  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3280  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.02 
 
 
484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  22.43 
 
 
492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  25.35 
 
 
488 aa  111  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  27.67 
 
 
458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  25 
 
 
488 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  25.07 
 
 
484 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.2 
 
 
485 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  26.6 
 
 
492 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  26.36 
 
 
491 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  25.42 
 
 
498 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  25.81 
 
 
459 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.99 
 
 
490 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.47 
 
 
486 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  26.47 
 
 
486 aa  108  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  26.67 
 
 
490 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0503  mannitol dehydrogenase  27.36 
 
 
482 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  26.65 
 
 
491 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  25.74 
 
 
488 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  26.2 
 
 
486 aa  107  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  25.74 
 
 
488 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  26.2 
 
 
486 aa  107  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  25 
 
 
470 aa  107  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  25.74 
 
 
488 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.71 
 
 
495 aa  106  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.2 
 
 
486 aa  106  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.53 
 
 
495 aa  106  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  25.89 
 
 
488 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0703  mannitol dehydrogenase family protein  26.08 
 
 
463 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2129  Mannitol dehydrogenase domain  28.53 
 
 
482 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  26.2 
 
 
486 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.93 
 
 
497 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  25.89 
 
 
488 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.22 
 
 
486 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.1 
 
 
487 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  25.66 
 
 
491 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>