251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1222 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 386 aa  785    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  82.9 
 
 		 386 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  98.45 
 
 		 386 aa  772    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  67.64 
 
 		 378 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  68.45 
 
 		 387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  68.98 
 
 		 387 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  68.45 
 
 		 387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  59.07 
 
 		 373 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2069  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.37 
 
 		 382 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.37 
 
 		 383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  46.65 
 
 		 378 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1609  putative altronate dehydrogenase  42.11 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0263  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.84 
 
 		 366 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  32.1 
 
 		 483 aa  143  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  32.63 
 
 		 483 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  32.63 
 
 		 483 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  32.63 
 
 		 483 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  32.63 
 
 		 483 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  32.63 
 
 		 483 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  32.63 
 
 		 483 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  32.63 
 
 		 483 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  32.63 
 
 		 483 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  31.65 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  31.38 
 
 		 483 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  31.47 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  31.56 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  27.76 
 
 		 485 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  29.18 
 
 		 481 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  29.21 
 
 		 505 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  28.92 
 
 		 482 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  31.55 
 
 		 481 aa  129  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  30.93 
 
 		 478 aa  129  9.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  31.1 
 
 		 481 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  28.53 
 
 		 496 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  29.44 
 
 		 507 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.72 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.88 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.2 
 
 		 525 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  30.67 
 
 		 488 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  28.14 
 
 		 501 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  30.77 
 
 		 488 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  32.28 
 
 		 514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  29.24 
 
 		 489 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.82 
 
 		 493 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  29.24 
 
 		 489 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  29.24 
 
 		 489 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  29.24 
 
 		 489 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  29.24 
 
 		 498 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  29.24 
 
 		 489 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  29.24 
 
 		 489 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.03 
 
 		 487 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0503  mannitol dehydrogenase  28.91 
 
 		 482 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3198  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.24 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  26.34 
 
 		 496 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  24.27 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  27.11 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  26.46 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.34 
 
 		 493 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1859  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.68 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.89 
 
 		 493 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  24.74 
 
 		 488 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  24.42 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.42 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  24.42 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  25 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  24.42 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.42 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  24.42 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  24.42 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  27.5 
 
 		 493 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0426  mannitol dehydrogenase-like  23.16 
 
 		 492 aa  71.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.321146 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3649  mannitol dehydrogenase Rossman-like  25 
 
 		 485 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0357773  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31040  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  28.22 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  22.34 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  28.15 
 
 		 471 aa  68.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  22.96 
 
 		 497 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.84 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.44 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.27 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  25.66 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  26.79 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  25.84 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  24.47 
 
 		 455 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  25 
 
 		 486 aa  67  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0073  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  27.78 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.804562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  24.61 
 
 		 486 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  23.1 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4796  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.6 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0601  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.11 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0788  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.7 
 
 		 486 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  24.59 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.59 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  24.59 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  24.2 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0053  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  24.36 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.51 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  24.59 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.15 
 
 		 486 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03455  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  27.06 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  23.22 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>