282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0073 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0073  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  100 
 
 
383 aa  780    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.804562  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3779  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  85.38 
 
 
387 aa  668    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4164  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  82.46 
 
 
382 aa  641    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4127  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  85.64 
 
 
387 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0027  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  85.38 
 
 
387 aa  669    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4446  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  81.41 
 
 
382 aa  632  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0053  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  80.89 
 
 
383 aa  626  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03455  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  77.23 
 
 
382 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0106  Mannitol dehydrogenase domain protein  76.96 
 
 
382 aa  598  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0112  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  76.96 
 
 
382 aa  598  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3933  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  77.23 
 
 
382 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3807  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  76.96 
 
 
382 aa  598  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0135  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  76.7 
 
 
387 aa  597  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.947643 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4099  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  76.96 
 
 
382 aa  598  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03406  hypothetical protein  77.23 
 
 
382 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4970  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  76.7 
 
 
382 aa  595  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4017  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  76.7 
 
 
382 aa  595  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91982  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4071  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  75.39 
 
 
382 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.541542  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3902  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  75.39 
 
 
382 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.970231  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3964  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  75.39 
 
 
382 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.866494  normal  0.811691 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3886  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  75.65 
 
 
382 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4009  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  75.39 
 
 
382 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.190736 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0089  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  64.92 
 
 
382 aa  500  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0195  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  64.64 
 
 
384 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00833  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  61.21 
 
 
382 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2814  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  59.95 
 
 
382 aa  468  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001633  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  60.95 
 
 
382 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.917395  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1251  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  59.38 
 
 
383 aa  456  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1384  Mannitol dehydrogenase domain protein  50.13 
 
 
381 aa  385  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00167811  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3409  Mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  46.01 
 
 
381 aa  340  4e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000437999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2794  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  45.9 
 
 
386 aa  311  9e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0056  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  44.06 
 
 
384 aa  301  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3788  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  45.63 
 
 
387 aa  296  3e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4003  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  45.65 
 
 
384 aa  286  5e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0271  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  37.24 
 
 
388 aa  268  8e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0030  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  36.8 
 
 
388 aa  268  1e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05975  Mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase (M1PDH)(MPDH)(MPD)(EC 1.1.1.17) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0F5]  40.87 
 
 
386 aa  266  5.999999999999999e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.735037 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0223  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.27 
 
 
383 aa  256  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2229  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  37.92 
 
 
368 aa  249  6e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2191  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  37.92 
 
 
368 aa  249  6e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07050  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  42.7 
 
 
379 aa  246  6e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1848  Mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  36.77 
 
 
376 aa  239  5e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3835  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.6 
 
 
384 aa  233  5e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.361477  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3209  Mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  31.51 
 
 
396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  31.92 
 
 
498 aa  124  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31040  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  30.42 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0032  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase, putative  24.42 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.49746  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.79 
 
 
497 aa  106  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  29.02 
 
 
496 aa  106  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  29.79 
 
 
490 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.79 
 
 
490 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  29.79 
 
 
452 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  27.66 
 
 
488 aa  104  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  29.7 
 
 
499 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.68 
 
 
495 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.24 
 
 
493 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.72 
 
 
495 aa  99.8  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  27.3 
 
 
488 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  27.97 
 
 
488 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  26.95 
 
 
488 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.95 
 
 
488 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  26.95 
 
 
488 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  26.95 
 
 
488 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.95 
 
 
488 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  29.03 
 
 
493 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  32.08 
 
 
493 aa  97.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  31.37 
 
 
510 aa  96.7  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  27.61 
 
 
458 aa  96.7  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.35 
 
 
485 aa  96.7  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  26.02 
 
 
488 aa  96.3  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3317  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.35 
 
 
431 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.41 
 
 
490 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  30.21 
 
 
471 aa  94.4  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.79 
 
 
486 aa  94  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  28.09 
 
 
488 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  28.09 
 
 
488 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  28.09 
 
 
488 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  28.09 
 
 
488 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  24.32 
 
 
490 aa  93.2  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.68 
 
 
490 aa  93.2  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  27.34 
 
 
486 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  28.09 
 
 
488 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5060  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.11 
 
 
483 aa  93.2  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.34 
 
 
486 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  27.34 
 
 
486 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  27.81 
 
 
520 aa  92.8  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  32.02 
 
 
491 aa  93.2  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  27.34 
 
 
486 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.94 
 
 
486 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  26.29 
 
 
451 aa  92.8  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  26.94 
 
 
486 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05330  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  29.51 
 
 
548 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  28.83 
 
 
497 aa  92.8  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0601  Mannitol dehydrogenase domain protein  31.02 
 
 
452 aa  92  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  27.57 
 
 
490 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  26.57 
 
 
486 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  26.57 
 
 
486 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  27.57 
 
 
490 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  27.57 
 
 
490 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  27.57 
 
 
490 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>