277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1603 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  99.79 
 
 		 483 aa  993    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  99.79 
 
 		 483 aa  993    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  72.73 
 
 		 481 aa  724    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  99.79 
 
 		 483 aa  993    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  72.73 
 
 		 481 aa  724    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  99.79 
 
 		 483 aa  993    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  72.44 
 
 		 483 aa  733    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  72.67 
 
 		 483 aa  746    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  72.65 
 
 		 483 aa  736    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  100 
 
 		 483 aa  994    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  72.26 
 
 		 483 aa  734    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  72.54 
 
 		 488 aa  740    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  100 
 
 		 483 aa  994    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  99.79 
 
 		 483 aa  993    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  100 
 
 		 483 aa  994    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  88.41 
 
 		 483 aa  894    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  72.13 
 
 		 488 aa  738    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  56.32 
 
 		 469 aa  539  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  43.49 
 
 		 482 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  42.07 
 
 		 485 aa  398  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  36.5 
 
 		 501 aa  295  8e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  38.03 
 
 		 478 aa  282  8.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.61 
 
 		 525 aa  282  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.06 
 
 		 513 aa  276  8e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  35.12 
 
 		 507 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  34.98 
 
 		 496 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.16 
 
 		 514 aa  265  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  34.5 
 
 		 481 aa  252  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  33.75 
 
 		 505 aa  251  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1685  altronate oxidoreductase  98.75 
 
 		 80 aa  167  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00119512  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.9 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32.46 
 
 		 386 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32.63 
 
 		 386 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  30 
 
 		 430 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  31.73 
 
 		 387 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.73 
 
 		 387 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  24.63 
 
 		 492 aa  133  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.35 
 
 		 373 aa  131  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  27.36 
 
 		 496 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0503  mannitol dehydrogenase  28 
 
 		 482 aa  130  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  31.03 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3970  mannitol dehydrogenase-like  26.61 
 
 		 473 aa  128  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  27.49 
 
 		 455 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  27.71 
 
 		 492 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2069  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.65 
 
 		 382 aa  126  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  26.83 
 
 		 464 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.27 
 
 		 383 aa  123  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  24.36 
 
 		 490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.16 
 
 		 493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4796  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.59 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.26 
 
 		 494 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.82 
 
 		 485 aa  117  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.64 
 
 		 486 aa  116  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  25.65 
 
 		 491 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.24 
 
 		 490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  24.24 
 
 		 490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  27.5 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  27.17 
 
 		 486 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3198  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.28 
 
 		 488 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  26.88 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.17 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  30.41 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  26.9 
 
 		 486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  26.9 
 
 		 486 aa  111  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.65 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.65 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  26.43 
 
 		 470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.62 
 
 		 505 aa  111  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  26.98 
 
 		 486 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  26.1 
 
 		 478 aa  110  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.03 
 
 		 486 aa  110  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31040  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  28.69 
 
 		 423 aa  109  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0788  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.37 
 
 		 486 aa  109  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.79 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  26.63 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  26.63 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5059  mannitol dehydrogenase domain protein  28.5 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000272821  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  24.7 
 
 		 490 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.43 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4096  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.02 
 
 		 488 aa  108  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3280  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.65 
 
 		 484 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  25.35 
 
 		 491 aa  107  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  24.65 
 
 		 452 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0730  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  26.43 
 
 		 470 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  26.48 
 
 		 486 aa  107  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.85 
 
 		 491 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.22 
 
 		 497 aa  107  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  26.67 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  25.43 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.67 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0634883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4739  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.91 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0950062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  26.43 
 
 		 486 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  26.18 
 
 		 491 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  24.8 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  23.9 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  24.8 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  25.29 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.96 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  22.27 
 
 		 488 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>