277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1160 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  100 
 
 		 505 aa  1031    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  49.6 
 
 		 507 aa  511  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  49.02 
 
 		 525 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  51.29 
 
 		 496 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  49.27 
 
 		 481 aa  455  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  47.34 
 
 		 513 aa  442  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  44.83 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  34.24 
 
 		 485 aa  278  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  34.67 
 
 		 488 aa  277  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  34.46 
 
 		 488 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  34.45 
 
 		 483 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  35 
 
 		 483 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  34.24 
 
 		 483 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  32.02 
 
 		 482 aa  271  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.61 
 
 		 469 aa  266  5e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  34.1 
 
 		 483 aa  265  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  34.72 
 
 		 483 aa  260  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  32.37 
 
 		 478 aa  260  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  33.95 
 
 		 483 aa  259  6e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  33.95 
 
 		 483 aa  259  6e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  33.95 
 
 		 483 aa  259  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  33.95 
 
 		 483 aa  259  6e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  33.95 
 
 		 483 aa  259  6e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  33.75 
 
 		 483 aa  258  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  33.75 
 
 		 483 aa  258  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  33.75 
 
 		 483 aa  258  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  33.54 
 
 		 481 aa  253  7e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  32.77 
 
 		 481 aa  247  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.15 
 
 		 514 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32.98 
 
 		 373 aa  170  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.52 
 
 		 378 aa  150  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  25 
 
 		 492 aa  146  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.03 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  30.56 
 
 		 387 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.56 
 
 		 387 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.85 
 
 		 387 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.47 
 
 		 386 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.21 
 
 		 386 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.85 
 
 		 495 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  24.52 
 
 		 488 aa  134  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  28.38 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  23.33 
 
 		 496 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.85 
 
 		 495 aa  131  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  23.75 
 
 		 510 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  24.56 
 
 		 451 aa  127  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.54 
 
 		 485 aa  126  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  25.12 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  24.51 
 
 		 488 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  23.87 
 
 		 488 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  23.87 
 
 		 488 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  23.87 
 
 		 488 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  23.86 
 
 		 488 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  23.86 
 
 		 488 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  26.15 
 
 		 489 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  26.15 
 
 		 498 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2069  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.46 
 
 		 382 aa  124  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  26.15 
 
 		 489 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  26.15 
 
 		 489 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  26.15 
 
 		 489 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  26.15 
 
 		 489 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  26.15 
 
 		 489 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  26.44 
 
 		 378 aa  124  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.47 
 
 		 486 aa  123  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3970  mannitol dehydrogenase-like  25.05 
 
 		 473 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  23.86 
 
 		 488 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2666  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.69 
 
 		 499 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  24.06 
 
 		 488 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  25.15 
 
 		 490 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  23.66 
 
 		 490 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.15 
 
 		 490 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1609  putative altronate dehydrogenase  28.3 
 
 		 366 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.64 
 
 		 460 aa  119  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.64 
 
 		 460 aa  119  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0263  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.02 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  24.18 
 
 		 498 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  26.28 
 
 		 486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  26.28 
 
 		 486 aa  117  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  26.28 
 
 		 486 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  26.28 
 
 		 486 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  22.5 
 
 		 493 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.06 
 
 		 486 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5060  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.54 
 
 		 483 aa  116  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5059  mannitol dehydrogenase domain protein  27.7 
 
 		 475 aa  116  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000272821  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.27 
 
 		 493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  26.06 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  27.11 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  28.13 
 
 		 487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.59872 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  25.84 
 
 		 486 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  25.84 
 
 		 486 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  27.93 
 
 		 452 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  23.58 
 
 		 493 aa  114  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  25.34 
 
 		 490 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3280  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.59 
 
 		 484 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  25.12 
 
 		 478 aa  113  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.38 
 
 		 497 aa  113  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  22.84 
 
 		 493 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  26.4 
 
 		 458 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  22.69 
 
 		 499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  24 
 
 		 505 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  23.83 
 
 		 464 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>