252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5477 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  82.9 
 
 
386 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  82.9 
 
 
386 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  100 
 
 
386 aa  785    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  69.76 
 
 
378 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  70.32 
 
 
387 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  68.98 
 
 
387 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  68.98 
 
 
387 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  58.24 
 
 
373 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2069  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  55.26 
 
 
382 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.51 
 
 
383 aa  319  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  44.73 
 
 
378 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1609  putative altronate dehydrogenase  42.36 
 
 
366 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0263  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.07 
 
 
366 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  29.97 
 
 
481 aa  140  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  30.62 
 
 
483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  28.84 
 
 
485 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  31.36 
 
 
483 aa  132  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  31.36 
 
 
483 aa  132  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  31.36 
 
 
483 aa  132  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  31.36 
 
 
483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  31.36 
 
 
483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  31.36 
 
 
483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  31.36 
 
 
483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  31.36 
 
 
483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  29.87 
 
 
496 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  31.25 
 
 
478 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.55 
 
 
525 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  27.61 
 
 
482 aa  129  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.67 
 
 
513 aa  129  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  29.49 
 
 
507 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  28.38 
 
 
505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  29.82 
 
 
483 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  29.55 
 
 
483 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  30.24 
 
 
481 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  30.24 
 
 
481 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  31.07 
 
 
483 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  29.89 
 
 
483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.23 
 
 
469 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  31.4 
 
 
514 aa  116  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  27.32 
 
 
501 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  29.71 
 
 
488 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  29.71 
 
 
488 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  28.28 
 
 
496 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  32.15 
 
 
489 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  32.15 
 
 
489 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  32.15 
 
 
489 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  32.15 
 
 
489 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  32.15 
 
 
489 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  32.15 
 
 
489 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  30.38 
 
 
498 aa  90.1  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.06 
 
 
493 aa  87  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0503  mannitol dehydrogenase  30.24 
 
 
482 aa  86.3  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  27.2 
 
 
498 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.35 
 
 
487 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  25.13 
 
 
488 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  25.74 
 
 
488 aa  82.4  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  24.87 
 
 
488 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.87 
 
 
488 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  24.87 
 
 
488 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  24.87 
 
 
488 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  28.35 
 
 
491 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.87 
 
 
488 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  24.87 
 
 
488 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  25.46 
 
 
488 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.11 
 
 
493 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  28.64 
 
 
492 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  25.76 
 
 
497 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  24.87 
 
 
492 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3317  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.97 
 
 
431 aa  73.9  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.54 
 
 
497 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  26.28 
 
 
478 aa  73.2  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0426  mannitol dehydrogenase-like  25.26 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.321146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  26.69 
 
 
492 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.39 
 
 
495 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.33 
 
 
493 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  24.25 
 
 
497 aa  70.5  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  25.52 
 
 
464 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  25.82 
 
 
486 aa  70.5  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3649  mannitol dehydrogenase Rossman-like  26.11 
 
 
485 aa  70.1  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0357773  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  25.52 
 
 
455 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  26.48 
 
 
452 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.37 
 
 
493 aa  68.9  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  26.67 
 
 
490 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1859  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.16 
 
 
470 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  26.48 
 
 
493 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.76 
 
 
486 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.67 
 
 
490 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  25.2 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0789  mannitol dehydrogenase family protein  24.7 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000484963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  25.2 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  26.98 
 
 
490 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  25.39 
 
 
486 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  25.26 
 
 
491 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  25.4 
 
 
486 aa  68.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.99 
 
 
509 aa  68.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  27.25 
 
 
490 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3198  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.08 
 
 
488 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  27.25 
 
 
490 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  22.19 
 
 
492 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  27.25 
 
 
490 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>