290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2321 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  97.13 
 
 		 488 aa  983    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  97.13 
 
 		 488 aa  983    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  97.13 
 
 		 488 aa  983    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  64.18 
 
 		 490 aa  646    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  97.75 
 
 		 488 aa  984    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  96.93 
 
 		 488 aa  981    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0789  mannitol dehydrogenase family protein  97.14 
 
 		 358 aa  714    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000484963  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  64.24 
 
 		 497 aa  650    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  96.93 
 
 		 488 aa  981    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  97.13 
 
 		 488 aa  983    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  100 
 
 		 488 aa  1010    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  64.18 
 
 		 490 aa  646    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  80.53 
 
 		 488 aa  830    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  63.37 
 
 		 493 aa  641    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  61.9 
 
 		 495 aa  625  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  61.9 
 
 		 495 aa  622  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  60.88 
 
 		 498 aa  611  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  56.29 
 
 		 487 aa  568  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  57.63 
 
 		 487 aa  566  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  55.53 
 
 		 488 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  56.08 
 
 		 486 aa  555  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  56.08 
 
 		 486 aa  555  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  57.33 
 
 		 488 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  57.11 
 
 		 488 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  55.6 
 
 		 486 aa  556  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  55.88 
 
 		 486 aa  554  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  55.88 
 
 		 486 aa  554  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  55.39 
 
 		 486 aa  553  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  56.9 
 
 		 488 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  56.08 
 
 		 486 aa  554  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  55.39 
 
 		 486 aa  551  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  56.41 
 
 		 488 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  56.08 
 
 		 486 aa  554  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  56.08 
 
 		 486 aa  554  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  56.9 
 
 		 488 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  55.17 
 
 		 486 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  54.55 
 
 		 490 aa  548  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  55.17 
 
 		 486 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  55.67 
 
 		 488 aa  551  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  55.88 
 
 		 486 aa  551  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  54.96 
 
 		 486 aa  547  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  54.96 
 
 		 486 aa  546  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  54.96 
 
 		 486 aa  546  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  55.1 
 
 		 490 aa  546  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  54.74 
 
 		 486 aa  545  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  56.6 
 
 		 490 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  61.76 
 
 		 452 aa  538  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  56.81 
 
 		 490 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  55.53 
 
 		 490 aa  536  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  56.81 
 
 		 490 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  56.6 
 
 		 490 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  56.38 
 
 		 490 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  49.79 
 
 		 490 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  49.58 
 
 		 490 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  49.79 
 
 		 490 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  49.79 
 
 		 490 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  49.27 
 
 		 492 aa  451  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  51.15 
 
 		 493 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  48.54 
 
 		 490 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  49.58 
 
 		 486 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  47.69 
 
 		 497 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  47.33 
 
 		 489 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  46.37 
 
 		 493 aa  398  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  47.17 
 
 		 485 aa  396  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.21 
 
 		 497 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  44.58 
 
 		 496 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  47.26 
 
 		 464 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  47.05 
 
 		 455 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  44.86 
 
 		 490 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  47.38 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.17 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  44.89 
 
 		 484 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.4 
 
 		 505 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  41.81 
 
 		 497 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  42.05 
 
 		 491 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  43.13 
 
 		 492 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  47.9 
 
 		 485 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  41.75 
 
 		 491 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  45.34 
 
 		 510 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5060  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.71 
 
 		 483 aa  364  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  45.38 
 
 		 478 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.51 
 
 		 491 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.36 
 
 		 505 aa  360  4e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  41.35 
 
 		 497 aa  356  5.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  41.42 
 
 		 491 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.29 
 
 		 492 aa  352  8e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  40.08 
 
 		 499 aa  351  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.42 
 
 		 506 aa  350  4e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.56 
 
 		 493 aa  348  2e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  41.81 
 
 		 520 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  41.25 
 
 		 497 aa  346  6e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  40.38 
 
 		 491 aa  344  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  38.87 
 
 		 493 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  42.68 
 
 		 471 aa  343  5e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  39.96 
 
 		 490 aa  341  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.29 
 
 		 528 aa  339  8e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.1 
 
 		 509 aa  338  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  42.86 
 
 		 451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  38.85 
 
 		 493 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.39 
 
 		 487 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>