290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0805 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  64.63 
 
 		 486 aa  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  64.63 
 
 		 486 aa  642    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  64.84 
 
 		 486 aa  643    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  64.63 
 
 		 486 aa  642    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  65.09 
 
 		 490 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  64.84 
 
 		 488 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  65.26 
 
 		 488 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  64.84 
 
 		 486 aa  645    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  65.05 
 
 		 486 aa  645    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  72.48 
 
 		 490 aa  724    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  65.05 
 
 		 488 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  65.26 
 
 		 488 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 488 aa  1007    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  93.6 
 
 		 488 aa  929    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  64.84 
 
 		 486 aa  644    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  65.05 
 
 		 486 aa  650    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  73.05 
 
 		 490 aa  714    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  64.63 
 
 		 486 aa  641    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  65.05 
 
 		 488 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  64.86 
 
 		 487 aa  653    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  59.38 
 
 		 493 aa  591  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  57.82 
 
 		 490 aa  581  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.82 
 
 		 490 aa  581  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  56.6 
 
 		 497 aa  570  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  56 
 
 		 495 aa  558  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  56.88 
 
 		 498 aa  561  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  56 
 
 		 495 aa  558  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  57.14 
 
 		 488 aa  551  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  55.88 
 
 		 488 aa  551  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  55.67 
 
 		 488 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  55.67 
 
 		 488 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  55.67 
 
 		 488 aa  550  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  55.67 
 
 		 488 aa  550  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  55.67 
 
 		 488 aa  550  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  55.67 
 
 		 488 aa  551  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  54.01 
 
 		 488 aa  540  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  52.6 
 
 		 487 aa  531  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  54.14 
 
 		 486 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  54.14 
 
 		 486 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  54.14 
 
 		 486 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  58.49 
 
 		 452 aa  512  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  54.14 
 
 		 486 aa  514  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  53.5 
 
 		 486 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  53.72 
 
 		 486 aa  510  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  53.5 
 
 		 486 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  53.93 
 
 		 486 aa  511  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  52.99 
 
 		 490 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  52.99 
 
 		 490 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  52.78 
 
 		 490 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  52.78 
 
 		 490 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  52.78 
 
 		 490 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  48.41 
 
 		 490 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  48.41 
 
 		 490 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  48.41 
 
 		 490 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  48.41 
 
 		 490 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  45.99 
 
 		 490 aa  421  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  48.72 
 
 		 493 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47.94 
 
 		 486 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  45.88 
 
 		 489 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0789  mannitol dehydrogenase family protein  55.1 
 
 		 358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000484963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  45.7 
 
 		 493 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  46.8 
 
 		 497 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  43.04 
 
 		 492 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  48.49 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  48.28 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  48.06 
 
 		 455 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  44.33 
 
 		 485 aa  371  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.33 
 
 		 497 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  40 
 
 		 490 aa  362  8e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  43.62 
 
 		 492 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  41.53 
 
 		 491 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  43.44 
 
 		 496 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  40.45 
 
 		 497 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  38.98 
 
 		 493 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  41.02 
 
 		 497 aa  351  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.75 
 
 		 494 aa  352  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  38.49 
 
 		 493 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  40.37 
 
 		 491 aa  348  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  44.35 
 
 		 510 aa  347  3e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.25 
 
 		 505 aa  344  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  43.27 
 
 		 485 aa  342  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  40.91 
 
 		 491 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  41.45 
 
 		 484 aa  340  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  38.52 
 
 		 491 aa  336  5.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  40.72 
 
 		 471 aa  335  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.79 
 
 		 491 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.24 
 
 		 505 aa  332  7.000000000000001e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.75 
 
 		 492 aa  331  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.36 
 
 		 493 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  43.49 
 
 		 498 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  43.49 
 
 		 489 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  43.49 
 
 		 489 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  43.49 
 
 		 489 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  43.49 
 
 		 489 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  43.49 
 
 		 489 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  43.49 
 
 		 489 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  40.68 
 
 		 478 aa  323  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.03 
 
 		 509 aa  322  7e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.04 
 
 		 487 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  38.57 
 
 		 497 aa  320  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>