290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0132 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  63.8 
 
 		 486 aa  648    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  64.42 
 
 		 486 aa  655    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  63.8 
 
 		 486 aa  648    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  64.01 
 
 		 486 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  63.11 
 
 		 490 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  64.42 
 
 		 486 aa  652    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  62.7 
 
 		 490 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  63.11 
 
 		 490 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  64.42 
 
 		 486 aa  653    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  100 
 
 		 487 aa  1014    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  64.42 
 
 		 486 aa  655    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  63.11 
 
 		 490 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  64.42 
 
 		 486 aa  654    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  63.11 
 
 		 490 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  58.97 
 
 		 497 aa  612  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  58.54 
 
 		 487 aa  580  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  57.02 
 
 		 488 aa  578  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.7 
 
 		 490 aa  576  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  57.7 
 
 		 490 aa  576  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  56.91 
 
 		 493 aa  575  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  56.82 
 
 		 488 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  56.61 
 
 		 488 aa  570  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  56.29 
 
 		 488 aa  568  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  55.24 
 
 		 495 aa  570  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  56.61 
 
 		 488 aa  570  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  56.4 
 
 		 488 aa  568  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  56.4 
 
 		 488 aa  568  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  56.67 
 
 		 488 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  56.88 
 
 		 488 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  56.4 
 
 		 488 aa  568  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  56.2 
 
 		 488 aa  565  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  54.83 
 
 		 495 aa  565  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  56.67 
 
 		 488 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  54.53 
 
 		 498 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  56.46 
 
 		 488 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  54.77 
 
 		 486 aa  556  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  55.65 
 
 		 490 aa  555  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  54.77 
 
 		 486 aa  555  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  56.25 
 
 		 488 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  54.77 
 
 		 486 aa  557  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  54.77 
 
 		 486 aa  556  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  55.79 
 
 		 490 aa  557  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  54.56 
 
 		 486 aa  554  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  54.56 
 
 		 486 aa  554  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  54.56 
 
 		 486 aa  553  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  54.56 
 
 		 486 aa  554  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  54.15 
 
 		 486 aa  548  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  53.89 
 
 		 488 aa  535  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  52.6 
 
 		 488 aa  531  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  51.45 
 
 		 490 aa  497  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  56.47 
 
 		 452 aa  484  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  48.73 
 
 		 490 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  48.73 
 
 		 490 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  48.73 
 
 		 490 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  48.52 
 
 		 490 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0789  mannitol dehydrogenase family protein  59.33 
 
 		 358 aa  444  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000484963  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  48.62 
 
 		 490 aa  444  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.3 
 
 		 493 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  44.06 
 
 		 492 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  43.67 
 
 		 489 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.97 
 
 		 486 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  44.16 
 
 		 497 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  42.47 
 
 		 493 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  43.75 
 
 		 496 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  42.37 
 
 		 485 aa  378  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  40.46 
 
 		 497 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3741  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  66.29 
 
 		 263 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  44.23 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  43.67 
 
 		 464 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  43.45 
 
 		 455 aa  362  8e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  41.99 
 
 		 484 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.49 
 
 		 494 aa  357  3.9999999999999996e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  42.33 
 
 		 485 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  39.02 
 
 		 499 aa  355  8.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  41.42 
 
 		 510 aa  355  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  41.06 
 
 		 492 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  39.71 
 
 		 490 aa  352  8.999999999999999e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.86 
 
 		 497 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  37.58 
 
 		 497 aa  344  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  39.07 
 
 		 491 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.7 
 
 		 491 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.48 
 
 		 493 aa  340  2e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.87 
 
 		 506 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  40.17 
 
 		 491 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  38.02 
 
 		 491 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.37 
 
 		 505 aa  335  9e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.9 
 
 		 528 aa  335  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.08 
 
 		 487 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  37.14 
 
 		 491 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.43 
 
 		 505 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  39.07 
 
 		 491 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  40.17 
 
 		 478 aa  331  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  37.26 
 
 		 493 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5060  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39 
 
 		 483 aa  329  6e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  37.76 
 
 		 471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  38.28 
 
 		 520 aa  328  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  39.34 
 
 		 489 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  39.34 
 
 		 489 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  39.34 
 
 		 489 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  39.34 
 
 		 489 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>