293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2405 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  88.35 
 
 
455 aa  822    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  87.36 
 
 
464 aa  820    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  100 
 
 
459 aa  922    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  67.67 
 
 
489 aa  621  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  64.07 
 
 
478 aa  538  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  57.6 
 
 
493 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  50.9 
 
 
492 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  52.16 
 
 
493 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  53.35 
 
 
490 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  52.75 
 
 
496 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  52.66 
 
 
486 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  48.16 
 
 
486 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  47.95 
 
 
486 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  48.16 
 
 
486 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  47.73 
 
 
486 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  47.73 
 
 
486 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  47.73 
 
 
486 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  50.11 
 
 
498 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  47.73 
 
 
486 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  47.73 
 
 
486 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  48.28 
 
 
488 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  51.96 
 
 
490 aa  398  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  48.47 
 
 
488 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  48.05 
 
 
493 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  47.38 
 
 
497 aa  396  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  48.25 
 
 
488 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  48.7 
 
 
488 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  48.7 
 
 
488 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  48.7 
 
 
488 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  48.7 
 
 
488 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  47.82 
 
 
488 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  48.04 
 
 
488 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  54 
 
 
505 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  49.03 
 
 
487 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  48.7 
 
 
488 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  48.58 
 
 
492 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  47.38 
 
 
488 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  48.16 
 
 
490 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  48.16 
 
 
490 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  48.18 
 
 
485 aa  382  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  50.12 
 
 
528 aa  381  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  47.08 
 
 
486 aa  378  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.62 
 
 
495 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  48.16 
 
 
490 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  46.02 
 
 
490 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  46.02 
 
 
490 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  47.93 
 
 
488 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  46.02 
 
 
490 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  46.02 
 
 
490 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  46.02 
 
 
490 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  48.15 
 
 
488 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  44.01 
 
 
487 aa  375  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  51.7 
 
 
509 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  47.93 
 
 
497 aa  378  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  47.93 
 
 
488 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  47.08 
 
 
486 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.87 
 
 
486 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  45.67 
 
 
491 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  47.71 
 
 
488 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  49.89 
 
 
493 aa  372  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  48.03 
 
 
488 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.97 
 
 
495 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  47.08 
 
 
486 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47.3 
 
 
486 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  46.87 
 
 
486 aa  375  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  46.65 
 
 
486 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  49.2 
 
 
485 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  47.08 
 
 
486 aa  371  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  46.65 
 
 
486 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  50.57 
 
 
510 aa  368  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.78 
 
 
494 aa  357  2.9999999999999997e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  42.26 
 
 
490 aa  356  3.9999999999999996e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  47.64 
 
 
520 aa  354  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.8 
 
 
491 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  46.24 
 
 
484 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  47.55 
 
 
452 aa  348  1e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.73 
 
 
497 aa  345  8e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  45.06 
 
 
491 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  46.12 
 
 
485 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  43.6 
 
 
497 aa  341  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  46.58 
 
 
451 aa  340  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  44.81 
 
 
499 aa  340  4e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  46.17 
 
 
458 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  43.52 
 
 
490 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  43.52 
 
 
490 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  43.52 
 
 
490 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  43.29 
 
 
490 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.91 
 
 
460 aa  332  6e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.91 
 
 
460 aa  332  6e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.23 
 
 
506 aa  332  1e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  40.27 
 
 
502 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  44.14 
 
 
491 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  44.44 
 
 
470 aa  325  1e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  41.16 
 
 
491 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  41.97 
 
 
497 aa  323  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1886  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.84 
 
 
485 aa  322  7e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.884338  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  39.48 
 
 
493 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  39.81 
 
 
500 aa  320  5e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  45.71 
 
 
503 aa  319  6e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1859  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.97 
 
 
470 aa  318  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>