292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3318 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  79.38 
 
 
486 aa  809    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  79.38 
 
 
486 aa  808    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  79.59 
 
 
486 aa  809    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  79.59 
 
 
486 aa  809    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  79.55 
 
 
486 aa  807    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  100 
 
 
490 aa  1018    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  99.39 
 
 
490 aa  1013    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  98.98 
 
 
490 aa  1008    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  79.38 
 
 
486 aa  805    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  63.11 
 
 
487 aa  661    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  79.75 
 
 
486 aa  808    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  79.38 
 
 
486 aa  808    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  99.59 
 
 
490 aa  1013    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  99.59 
 
 
490 aa  1014    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  60.25 
 
 
497 aa  587  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  57.26 
 
 
498 aa  559  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  56.97 
 
 
495 aa  558  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  58.07 
 
 
493 aa  559  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  57.53 
 
 
486 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  57.45 
 
 
488 aa  555  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  57.32 
 
 
486 aa  554  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  57.23 
 
 
488 aa  552  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  57.23 
 
 
488 aa  552  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  57.23 
 
 
488 aa  552  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  56.94 
 
 
488 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  57.23 
 
 
488 aa  552  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.23 
 
 
488 aa  552  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  56.94 
 
 
488 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  57.11 
 
 
486 aa  552  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.11 
 
 
486 aa  554  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  57.11 
 
 
486 aa  554  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  57.11 
 
 
486 aa  553  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  57.53 
 
 
487 aa  553  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  57.14 
 
 
488 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  57.5 
 
 
490 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  57.11 
 
 
486 aa  551  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  57.45 
 
 
488 aa  550  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  56.94 
 
 
488 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  56.73 
 
 
495 aa  550  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  57.14 
 
 
488 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.5 
 
 
490 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  55.51 
 
 
488 aa  550  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  56.7 
 
 
486 aa  547  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  56.81 
 
 
488 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  56.7 
 
 
486 aa  547  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  56.67 
 
 
490 aa  545  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  54.49 
 
 
490 aa  525  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  53.93 
 
 
488 aa  521  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  52.99 
 
 
488 aa  510  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  54.7 
 
 
490 aa  509  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  57.35 
 
 
452 aa  482  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  50.74 
 
 
493 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  48.32 
 
 
490 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  48.32 
 
 
490 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  48.32 
 
 
490 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  48.11 
 
 
490 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  49.05 
 
 
490 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  46.33 
 
 
492 aa  438  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  50.94 
 
 
486 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3741  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  78.03 
 
 
263 aa  434  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  47.05 
 
 
489 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  48.33 
 
 
497 aa  418  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0789  mannitol dehydrogenase family protein  57.31 
 
 
358 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000484963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  45.8 
 
 
493 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  46.04 
 
 
485 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  44.08 
 
 
496 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  47.1 
 
 
455 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  47.1 
 
 
464 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  45.32 
 
 
492 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  46.02 
 
 
459 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  45.71 
 
 
478 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.38 
 
 
497 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  40.62 
 
 
491 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  41.63 
 
 
497 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  46.9 
 
 
485 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.51 
 
 
494 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  41.1 
 
 
497 aa  365  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  39.51 
 
 
491 aa  364  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41 
 
 
491 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  40.41 
 
 
491 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  44.26 
 
 
484 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.4 
 
 
509 aa  358  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.2 
 
 
505 aa  357  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  41.34 
 
 
497 aa  354  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  40.2 
 
 
493 aa  352  8e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.55 
 
 
505 aa  352  1e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  40.2 
 
 
493 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  40.08 
 
 
490 aa  350  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.89 
 
 
493 aa  349  7e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  41.21 
 
 
490 aa  348  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  39.71 
 
 
499 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.92 
 
 
506 aa  347  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  42.95 
 
 
471 aa  345  7e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.93 
 
 
487 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  42 
 
 
510 aa  339  8e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.57 
 
 
528 aa  338  9e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  43.27 
 
 
491 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.52 
 
 
485 aa  336  7e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  38.93 
 
 
491 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  39.26 
 
 
520 aa  333  6e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>