290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_04192 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  99.18 
 
 		 486 aa  1004    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  98.97 
 
 		 486 aa  1004    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  100 
 
 		 486 aa  1013    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  99.79 
 
 		 486 aa  1012    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  79.18 
 
 		 490 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  78.93 
 
 		 490 aa  786    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  99.38 
 
 		 486 aa  1007    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  100 
 
 		 486 aa  1013    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  99.18 
 
 		 486 aa  1006    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  78.93 
 
 		 490 aa  787    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  63.8 
 
 		 487 aa  648    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  99.18 
 
 		 486 aa  1006    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  79.55 
 
 		 490 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  79.13 
 
 		 490 aa  789    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  59.75 
 
 		 497 aa  592  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  57.32 
 
 		 488 aa  572  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  58.52 
 
 		 493 aa  570  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  59.11 
 
 		 487 aa  562  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  58.69 
 
 		 486 aa  558  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  55.88 
 
 		 488 aa  555  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  55.88 
 
 		 488 aa  555  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  56.08 
 
 		 488 aa  558  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  55.88 
 
 		 488 aa  555  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  55.88 
 
 		 488 aa  555  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  55.88 
 
 		 488 aa  555  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  58.69 
 
 		 490 aa  554  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  58.69 
 
 		 490 aa  554  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  57.84 
 
 		 486 aa  551  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  59.53 
 
 		 488 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  56.08 
 
 		 488 aa  554  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  59.53 
 
 		 488 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  55.88 
 
 		 488 aa  554  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  59.32 
 
 		 488 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  59.32 
 
 		 488 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  57.84 
 
 		 486 aa  549  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  58.05 
 
 		 486 aa  551  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  59.32 
 
 		 488 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  55.42 
 
 		 495 aa  551  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  57.63 
 
 		 486 aa  549  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.63 
 
 		 486 aa  550  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  55.85 
 
 		 498 aa  548  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  57.63 
 
 		 486 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  57.63 
 
 		 486 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  55.62 
 
 		 495 aa  546  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  57.63 
 
 		 486 aa  548  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3741  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  97.72 
 
 		 263 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  56.39 
 
 		 490 aa  532  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  55.56 
 
 		 490 aa  531  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  53.57 
 
 		 488 aa  514  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  53.5 
 
 		 488 aa  509  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  53.86 
 
 		 490 aa  498  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  59.05 
 
 		 452 aa  484  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  48.84 
 
 		 490 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  48.84 
 
 		 490 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  48.84 
 
 		 490 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  48.63 
 
 		 490 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  50.84 
 
 		 493 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  48.73 
 
 		 490 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  51.06 
 
 		 486 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  46.11 
 
 		 492 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  47.92 
 
 		 497 aa  420  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  46.82 
 
 		 489 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  47.72 
 
 		 485 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0789  mannitol dehydrogenase family protein  56.66 
 
 		 358 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000484963  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  48.37 
 
 		 455 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  48.15 
 
 		 464 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  47.95 
 
 		 459 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  44.75 
 
 		 493 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  44.75 
 
 		 496 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  42.95 
 
 		 491 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.1 
 
 		 497 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  45.47 
 
 		 478 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  45.12 
 
 		 492 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.65 
 
 		 491 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  42.53 
 
 		 491 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  41.58 
 
 		 490 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  41.46 
 
 		 497 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.5 
 
 		 505 aa  369  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  45.88 
 
 		 484 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.8 
 
 		 505 aa  363  3e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  42.26 
 
 		 497 aa  363  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.38 
 
 		 494 aa  362  7.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  41.94 
 
 		 497 aa  360  4e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  40.59 
 
 		 499 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  40.47 
 
 		 491 aa  356  5.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  46.65 
 
 		 485 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  42.64 
 
 		 471 aa  351  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  40.71 
 
 		 491 aa  350  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.47 
 
 		 485 aa  349  5e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  40.85 
 
 		 490 aa  349  7e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.51 
 
 		 506 aa  347  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  41.39 
 
 		 493 aa  346  6e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  40.17 
 
 		 493 aa  345  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  44.03 
 
 		 510 aa  344  2.9999999999999997e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.79 
 
 		 492 aa  343  4e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  39.75 
 
 		 500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.54 
 
 		 509 aa  338  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  39.79 
 
 		 520 aa  336  5e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.59 
 
 		 528 aa  331  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  42.79 
 
 		 489 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>