295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0583 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  100 
 
 
510 aa  989    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  59.63 
 
 
493 aa  546  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  57.02 
 
 
451 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  48.02 
 
 
492 aa  457  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  54.05 
 
 
486 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  54.07 
 
 
493 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  52.85 
 
 
493 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05330  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  51.7 
 
 
548 aa  415  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  46.64 
 
 
497 aa  415  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  49.47 
 
 
493 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3280  Mannitol dehydrogenase domain protein  51.91 
 
 
484 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  50.85 
 
 
478 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3014  Mannitol dehydrogenase domain protein  53.09 
 
 
501 aa  392  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.264666  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  47.58 
 
 
488 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  47.79 
 
 
488 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  47.58 
 
 
488 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  47.37 
 
 
488 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  47.59 
 
 
488 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  42.92 
 
 
490 aa  388  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  46.78 
 
 
489 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  48.84 
 
 
496 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  47.01 
 
 
484 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  45.77 
 
 
488 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.77 
 
 
488 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  45.77 
 
 
488 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.77 
 
 
488 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  45.34 
 
 
488 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.49 
 
 
495 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  45.77 
 
 
488 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  45.55 
 
 
488 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  44.72 
 
 
487 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.85 
 
 
497 aa  378  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.94 
 
 
495 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  45.55 
 
 
488 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  49.55 
 
 
464 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  49.39 
 
 
505 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  44.44 
 
 
486 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  44.65 
 
 
486 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  44.44 
 
 
486 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  50.57 
 
 
459 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  44.44 
 
 
486 aa  368  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  44.44 
 
 
486 aa  368  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.44 
 
 
486 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  49.1 
 
 
455 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.23 
 
 
486 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  41.42 
 
 
487 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  44.58 
 
 
488 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  44.23 
 
 
486 aa  365  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  44.23 
 
 
486 aa  365  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.16 
 
 
497 aa  364  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  46.12 
 
 
498 aa  363  3e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  52 
 
 
430 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.38 
 
 
493 aa  362  7.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  49.57 
 
 
485 aa  362  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.82 
 
 
488 aa  362  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  46.48 
 
 
485 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.54 
 
 
490 aa  360  4e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  44.15 
 
 
486 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.15 
 
 
486 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  44.15 
 
 
486 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  43.94 
 
 
486 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.19 
 
 
490 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.35 
 
 
488 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  43.94 
 
 
486 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  43.94 
 
 
486 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47.14 
 
 
509 aa  356  5e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  43.74 
 
 
486 aa  355  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  45.47 
 
 
492 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  44.21 
 
 
491 aa  354  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  44.21 
 
 
486 aa  353  4e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  46.19 
 
 
470 aa  353  5e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  48.67 
 
 
487 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  49.76 
 
 
491 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  48.86 
 
 
489 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  48.86 
 
 
498 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  48.86 
 
 
489 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  48.86 
 
 
489 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  48.86 
 
 
489 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  48.86 
 
 
489 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  48.86 
 
 
489 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.01 
 
 
490 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  43.01 
 
 
490 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  42 
 
 
490 aa  350  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  45.32 
 
 
490 aa  349  5e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  42 
 
 
490 aa  350  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  42 
 
 
490 aa  349  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  42 
 
 
490 aa  349  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  41.79 
 
 
490 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.75 
 
 
460 aa  347  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.75 
 
 
460 aa  347  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.44 
 
 
485 aa  343  2.9999999999999997e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2666  Mannitol dehydrogenase domain protein  49.5 
 
 
499 aa  339  8e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5060  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.47 
 
 
483 aa  333  4e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.37 
 
 
494 aa  332  9e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  43.11 
 
 
499 aa  329  6e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  46.81 
 
 
458 aa  329  8e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1886  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  48.87 
 
 
485 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.884338  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  43.37 
 
 
503 aa  320  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  42.2 
 
 
491 aa  319  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  37.74 
 
 
502 aa  317  3e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>