294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3566 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  63.83 
 
 
486 aa  636    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  65.5 
 
 
488 aa  663    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
490 aa  1009    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  66.87 
 
 
490 aa  661    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  63.62 
 
 
486 aa  636    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  63.62 
 
 
486 aa  635    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  65.09 
 
 
488 aa  657    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  67.08 
 
 
490 aa  650    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  63.41 
 
 
486 aa  631  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  63.41 
 
 
486 aa  631  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  63.41 
 
 
486 aa  630  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  63.2 
 
 
486 aa  628  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  63.2 
 
 
486 aa  628  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  63.2 
 
 
486 aa  628  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  63.83 
 
 
488 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  63.62 
 
 
488 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  63.62 
 
 
488 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  63.62 
 
 
488 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  62.99 
 
 
488 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  62.37 
 
 
487 aa  624  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.44 
 
 
493 aa  573  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  56.11 
 
 
497 aa  568  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  55.51 
 
 
488 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  55.31 
 
 
488 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  55.31 
 
 
488 aa  560  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  55.31 
 
 
488 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  55.31 
 
 
488 aa  560  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  55.1 
 
 
488 aa  560  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  55.31 
 
 
488 aa  560  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  55.51 
 
 
488 aa  561  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  55.79 
 
 
498 aa  555  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  55.11 
 
 
495 aa  547  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  55.44 
 
 
490 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  54.37 
 
 
495 aa  547  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  55.44 
 
 
490 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  53.58 
 
 
488 aa  533  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  54.07 
 
 
486 aa  510  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  53.86 
 
 
486 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  53.86 
 
 
486 aa  509  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  54.07 
 
 
486 aa  509  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  51.45 
 
 
487 aa  509  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  53.88 
 
 
486 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  54.07 
 
 
486 aa  510  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  53.86 
 
 
486 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  54.07 
 
 
486 aa  509  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  54.7 
 
 
490 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  54.7 
 
 
490 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  54.7 
 
 
490 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  54.7 
 
 
490 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  54.7 
 
 
490 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  57.04 
 
 
452 aa  479  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  50.31 
 
 
493 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  46.2 
 
 
492 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  49.49 
 
 
486 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  45.76 
 
 
490 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  45.76 
 
 
490 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  48.55 
 
 
497 aa  418  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  45.76 
 
 
490 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  45.55 
 
 
490 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0789  mannitol dehydrogenase family protein  55.27 
 
 
358 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000484963  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  47 
 
 
485 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  46.07 
 
 
489 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  45.92 
 
 
493 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  49.67 
 
 
455 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.19 
 
 
497 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  49.67 
 
 
464 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  43.67 
 
 
490 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  48.16 
 
 
459 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  44.94 
 
 
492 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  44.83 
 
 
496 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  42.68 
 
 
491 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  43.4 
 
 
484 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.34 
 
 
494 aa  359  5e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  40.28 
 
 
493 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  44.02 
 
 
485 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  41.6 
 
 
497 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  44.54 
 
 
510 aa  351  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  42.27 
 
 
491 aa  349  5e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  39.47 
 
 
493 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  39.18 
 
 
490 aa  348  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  40.73 
 
 
497 aa  347  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.63 
 
 
505 aa  346  7e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  39.88 
 
 
490 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  43.22 
 
 
478 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  40.53 
 
 
491 aa  342  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  41.23 
 
 
491 aa  336  5.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40 
 
 
491 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.1 
 
 
493 aa  335  1e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  40.99 
 
 
520 aa  330  4e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.92 
 
 
492 aa  330  5.0000000000000004e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.85 
 
 
505 aa  325  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.23 
 
 
509 aa  324  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  39.6 
 
 
497 aa  323  4e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  41.51 
 
 
471 aa  323  5e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  37.39 
 
 
500 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.04 
 
 
506 aa  318  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  38.29 
 
 
499 aa  315  9e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  44.18 
 
 
491 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  42.24 
 
 
503 aa  313  5.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.94 
 
 
487 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>