290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1623 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  98.77 
 
 		 486 aa  994    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  98.35 
 
 		 486 aa  993    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  98.15 
 
 		 486 aa  991    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  70.73 
 
 		 490 aa  693    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  82.44 
 
 		 488 aa  832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  100 
 
 		 486 aa  1008    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  71.79 
 
 		 490 aa  693    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  98.97 
 
 		 486 aa  998    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  98.15 
 
 		 486 aa  990    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  65.05 
 
 		 488 aa  656    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  98.56 
 
 		 486 aa  996    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  82.02 
 
 		 488 aa  825    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  81.61 
 
 		 488 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  65.05 
 
 		 488 aa  650    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  82.23 
 
 		 488 aa  830    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  98.77 
 
 		 486 aa  994    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  98.35 
 
 		 486 aa  992    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  78.72 
 
 		 487 aa  809    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  82.23 
 
 		 488 aa  830    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  63.62 
 
 		 490 aa  630  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  58.68 
 
 		 493 aa  591  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  56.96 
 
 		 497 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  58.26 
 
 		 490 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  58.26 
 
 		 490 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  56.55 
 
 		 498 aa  568  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  59.11 
 
 		 486 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  58.69 
 
 		 486 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  58.9 
 
 		 486 aa  560  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  59.11 
 
 		 486 aa  561  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  58.9 
 
 		 486 aa  560  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  58.69 
 
 		 486 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  59.11 
 
 		 486 aa  560  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  58.9 
 
 		 486 aa  557  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  55.17 
 
 		 488 aa  555  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  55.17 
 
 		 488 aa  555  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  55.39 
 
 		 488 aa  557  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  55.6 
 
 		 488 aa  556  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  55.17 
 
 		 488 aa  555  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  55.82 
 
 		 488 aa  557  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  54.77 
 
 		 487 aa  557  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  55.17 
 
 		 488 aa  555  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  55.17 
 
 		 488 aa  555  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  54.58 
 
 		 488 aa  546  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  57.11 
 
 		 490 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  56.91 
 
 		 490 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  56.91 
 
 		 490 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  57.11 
 
 		 490 aa  545  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  54.62 
 
 		 495 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  56.7 
 
 		 490 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  54.2 
 
 		 495 aa  535  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  59.76 
 
 		 452 aa  524  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  48.31 
 
 		 490 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  48.31 
 
 		 490 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  48.1 
 
 		 490 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  48.31 
 
 		 490 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  49.79 
 
 		 490 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  50.21 
 
 		 493 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  43.94 
 
 		 492 aa  430  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0789  mannitol dehydrogenase family protein  56.12 
 
 		 358 aa  412  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000484963  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  47.08 
 
 		 489 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47.29 
 
 		 486 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  45.83 
 
 		 497 aa  405  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  43.8 
 
 		 485 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  44.26 
 
 		 493 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  45.36 
 
 		 484 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  47.3 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  45.36 
 
 		 485 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  47.3 
 
 		 464 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  43.69 
 
 		 492 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.17 
 
 		 497 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  47.08 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  45.99 
 
 		 478 aa  362  8e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.37 
 
 		 494 aa  362  9e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  43.29 
 
 		 496 aa  360  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  44.44 
 
 		 510 aa  359  7e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  41.96 
 
 		 497 aa  358  8e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.01 
 
 		 505 aa  350  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  40.21 
 
 		 491 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  42.83 
 
 		 520 aa  349  6e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  42.86 
 
 		 499 aa  348  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  40.29 
 
 		 497 aa  346  6e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  41.34 
 
 		 497 aa  345  7e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  40.54 
 
 		 471 aa  345  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.51 
 
 		 505 aa  343  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  41.47 
 
 		 490 aa  343  5e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.98 
 
 		 493 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  38.83 
 
 		 491 aa  338  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  39.43 
 
 		 493 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.86 
 
 		 528 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  39.79 
 
 		 491 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3741  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  62.21 
 
 		 263 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.75 
 
 		 491 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  38.45 
 
 		 502 aa  334  2e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  39.01 
 
 		 493 aa  333  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  44.98 
 
 		 489 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  44.98 
 
 		 498 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  38.92 
 
 		 490 aa  332  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  44.98 
 
 		 489 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  44.98 
 
 		 489 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  44.98 
 
 		 489 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>