296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2702 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  64.61 
 
 
495 aa  669    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  72.58 
 
 
493 aa  738    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  64.18 
 
 
488 aa  662    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  100 
 
 
490 aa  1012    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  64.18 
 
 
488 aa  662    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  63.98 
 
 
488 aa  659    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  64.18 
 
 
488 aa  662    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  67.84 
 
 
498 aa  703    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  71.28 
 
 
497 aa  738    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  64.75 
 
 
495 aa  671    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  64.18 
 
 
488 aa  662    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  63.98 
 
 
488 aa  659    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  64.18 
 
 
488 aa  660    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  64.8 
 
 
488 aa  665    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  99.53 
 
 
452 aa  877    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
490 aa  1012    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  65.22 
 
 
488 aa  674    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  60.54 
 
 
488 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  60.74 
 
 
488 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  60.54 
 
 
488 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  60.74 
 
 
488 aa  611  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  60.12 
 
 
488 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  60.83 
 
 
490 aa  607  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  59.92 
 
 
487 aa  602  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  57.82 
 
 
488 aa  592  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  57.7 
 
 
487 aa  592  1e-168  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  60.5 
 
 
490 aa  593  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  58.37 
 
 
488 aa  594  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  58.26 
 
 
486 aa  590  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  58.06 
 
 
486 aa  589  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  58.06 
 
 
486 aa  587  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  58.06 
 
 
486 aa  586  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  57.64 
 
 
486 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  57.85 
 
 
486 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.64 
 
 
486 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  57.64 
 
 
486 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  57.64 
 
 
486 aa  581  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  59.1 
 
 
486 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  59.1 
 
 
486 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  58.69 
 
 
486 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  58.9 
 
 
486 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  58.9 
 
 
486 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  58.69 
 
 
486 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  58.9 
 
 
486 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  58.9 
 
 
486 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  55.44 
 
 
490 aa  554  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  57.5 
 
 
490 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  57.71 
 
 
490 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  57.5 
 
 
490 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  57.71 
 
 
490 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  57.71 
 
 
490 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0789  mannitol dehydrogenase family protein  67.71 
 
 
358 aa  508  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000484963  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  47.97 
 
 
490 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  47.97 
 
 
490 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  47.76 
 
 
490 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  47.97 
 
 
490 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  50 
 
 
490 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  49.37 
 
 
493 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  48.33 
 
 
486 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  43.71 
 
 
492 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  46.79 
 
 
489 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  45.77 
 
 
497 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  48.6 
 
 
455 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  48.82 
 
 
464 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  48.16 
 
 
459 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  45.89 
 
 
485 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  42.95 
 
 
491 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  45.61 
 
 
496 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  44.63 
 
 
493 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.15 
 
 
491 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  42.95 
 
 
491 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.77 
 
 
494 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  44.4 
 
 
484 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  44.95 
 
 
492 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  42.36 
 
 
491 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  43.66 
 
 
490 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  44.42 
 
 
485 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  46.32 
 
 
478 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  42.44 
 
 
497 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.2 
 
 
505 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  40.82 
 
 
493 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  40.41 
 
 
493 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  42.47 
 
 
499 aa  361  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.03 
 
 
497 aa  360  4e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  41.07 
 
 
491 aa  359  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  40.04 
 
 
490 aa  346  7e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  41.81 
 
 
520 aa  346  7e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.12 
 
 
493 aa  345  8e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.3 
 
 
505 aa  344  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  43.01 
 
 
510 aa  342  5.999999999999999e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  46.21 
 
 
489 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  46.21 
 
 
498 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  40.66 
 
 
471 aa  341  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.35 
 
 
487 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  46.21 
 
 
489 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  46.21 
 
 
489 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  46.21 
 
 
489 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  46.21 
 
 
489 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  46.21 
 
 
489 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  38.91 
 
 
497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>