292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1903 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  61.19 
 
 		 500 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 506 aa  1053    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  52.44 
 
 		 484 aa  519  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  47.28 
 
 		 497 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  47.72 
 
 		 497 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.02 
 
 		 492 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.68 
 
 		 505 aa  468  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  46.71 
 
 		 503 aa  447  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.08 
 
 		 494 aa  448  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  45.34 
 
 		 493 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.61 
 
 		 528 aa  439  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  46.14 
 
 		 493 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  44.68 
 
 		 491 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  44.63 
 
 		 491 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  42.38 
 
 		 497 aa  425  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  48.35 
 
 		 490 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.61 
 
 		 491 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  41.54 
 
 		 472 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.54 
 
 		 472 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0634883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4739  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.98 
 
 		 472 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0950062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  48.35 
 
 		 491 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  45.71 
 
 		 491 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  41.35 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  43.39 
 
 		 502 aa  397  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  41.35 
 
 		 520 aa  392  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3446  Mannitol dehydrogenase domain  40.65 
 
 		 493 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.85 
 
 		 494 aa  392  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3748  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  41.06 
 
 		 493 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3962  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.97 
 
 		 488 aa  388  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25102  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  41.41 
 
 		 497 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2459  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.21 
 
 		 589 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.67 
 
 		 659 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  39.96 
 
 		 495 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  38.08 
 
 		 493 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3848  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.02 
 
 		 494 aa  365  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.611991  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  40 
 
 		 492 aa  363  4e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.96 
 
 		 486 aa  361  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.59 
 
 		 505 aa  360  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1732  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.02 
 
 		 477 aa  359  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0096  mannitol dehydrogenase  39.02 
 
 		 477 aa  359  7e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.027752  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.49 
 
 		 493 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1685  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.81 
 
 		 477 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  39.58 
 
 		 489 aa  352  7e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  40.26 
 
 		 496 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  40.51 
 
 		 488 aa  351  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4177  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.47 
 
 		 487 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  40.42 
 
 		 488 aa  350  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  39.92 
 
 		 488 aa  349  5e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  39.46 
 
 		 488 aa  349  7e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  39.83 
 
 		 488 aa  349  7e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.46 
 
 		 488 aa  349  7e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.83 
 
 		 488 aa  349  7e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  39.46 
 
 		 488 aa  349  7e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  40.51 
 
 		 486 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  40.51 
 
 		 486 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2907  mannitol dehydrogenase-like  38.96 
 
 		 499 aa  346  5e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554349 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.3 
 
 		 486 aa  345  7e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  40.08 
 
 		 486 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  40.08 
 
 		 486 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  40.08 
 
 		 486 aa  343  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  41.23 
 
 		 486 aa  343  5.999999999999999e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0426  mannitol dehydrogenase-like  37.37 
 
 		 492 aa  342  8e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.321146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  39.87 
 
 		 486 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  39.2 
 
 		 492 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  39.87 
 
 		 486 aa  340  5e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  39.71 
 
 		 490 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  39.92 
 
 		 490 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  37.87 
 
 		 487 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  39.92 
 
 		 490 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  39.5 
 
 		 490 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  37.66 
 
 		 488 aa  336  7.999999999999999e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3727  mannitol dehydrogenase Rossman-like  41.63 
 
 		 509 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  39.17 
 
 		 490 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0969  mannitol dehydrogenase domain protein  38.43 
 
 		 499 aa  335  1e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.124507 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4641  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.63 
 
 		 509 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5663  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.16 
 
 		 509 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733675 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  40.23 
 
 		 459 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  38.14 
 
 		 498 aa  326  6e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  39.07 
 
 		 455 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  39.3 
 
 		 464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.22 
 
 		 509 aa  320  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  39.38 
 
 		 490 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  39.64 
 
 		 490 aa  320  3.9999999999999996e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.38 
 
 		 490 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.05 
 
 		 485 aa  318  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  36.09 
 
 		 490 aa  317  4e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.03 
 
 		 497 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.46 
 
 		 488 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3090  Mannitol dehydrogenase domain  38.69 
 
 		 506 aa  313  3.9999999999999997e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.3 
 
 		 490 aa  312  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.04 
 
 		 490 aa  310  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.8 
 
 		 488 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.39 
 
 		 497 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  36.81 
 
 		 487 aa  307  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  35.58 
 
 		 488 aa  306  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.39 
 
 		 495 aa  306  8.000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  35.58 
 
 		 488 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  35.37 
 
 		 488 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.17 
 
 		 495 aa  303  6.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  35.37 
 
 		 488 aa  302  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>