289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3748 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  70.39 
 
 
495 aa  712    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3446  Mannitol dehydrogenase domain  94.73 
 
 
493 aa  964    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2459  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  74.95 
 
 
589 aa  778    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  76.39 
 
 
659 aa  785    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3748  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  100 
 
 
493 aa  1006    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29715  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  73.02 
 
 
494 aa  744    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3848  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  62.12 
 
 
494 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.611991  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4177  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  61.4 
 
 
487 aa  566  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25233  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1732  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.32 
 
 
477 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163277  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0096  mannitol dehydrogenase  57.14 
 
 
477 aa  542  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.027752  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1685  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  56.09 
 
 
477 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0426  mannitol dehydrogenase-like  48.87 
 
 
492 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.321146 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  45.53 
 
 
497 aa  429  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0969  mannitol dehydrogenase domain protein  47.95 
 
 
499 aa  422  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.124507 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2907  mannitol dehydrogenase-like  47.84 
 
 
499 aa  415  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.04 
 
 
505 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.3 
 
 
494 aa  415  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  45.13 
 
 
497 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  44.67 
 
 
491 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.79 
 
 
491 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  45.4 
 
 
503 aa  390  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.06 
 
 
506 aa  391  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  44.47 
 
 
491 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  40.17 
 
 
500 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  43.89 
 
 
497 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  44.67 
 
 
491 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.38 
 
 
492 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  43.81 
 
 
493 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  44.26 
 
 
490 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  45.01 
 
 
491 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  44.65 
 
 
493 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3962  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.75 
 
 
488 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25102  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  42.09 
 
 
499 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  40.79 
 
 
484 aa  364  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  41.15 
 
 
520 aa  361  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4739  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.61 
 
 
472 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0950062  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  41.41 
 
 
472 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.41 
 
 
472 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0634883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.71 
 
 
528 aa  350  4e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  37.58 
 
 
502 aa  330  5.0000000000000004e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3090  Mannitol dehydrogenase domain  41.98 
 
 
506 aa  322  7e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  36.81 
 
 
497 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  37.07 
 
 
493 aa  312  9e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.37 
 
 
486 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.9 
 
 
495 aa  303  5.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.18 
 
 
495 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.37 
 
 
493 aa  302  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  37.11 
 
 
486 aa  301  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  37.11 
 
 
486 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  37.11 
 
 
486 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  37.11 
 
 
486 aa  300  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  37.11 
 
 
486 aa  300  3e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  40.24 
 
 
496 aa  301  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  36.98 
 
 
486 aa  300  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.91 
 
 
486 aa  299  6e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  37.37 
 
 
488 aa  298  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  36.42 
 
 
490 aa  297  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  36.93 
 
 
488 aa  298  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  36.91 
 
 
486 aa  297  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  36.72 
 
 
488 aa  296  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  38.01 
 
 
488 aa  296  6e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  38.58 
 
 
489 aa  295  9e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  36.99 
 
 
488 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.99 
 
 
488 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  40.33 
 
 
492 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  36.99 
 
 
488 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.01 
 
 
493 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  37.11 
 
 
490 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  36.99 
 
 
488 aa  295  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.99 
 
 
488 aa  295  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  37.11 
 
 
490 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  37.11 
 
 
490 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  37.11 
 
 
490 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  36.9 
 
 
490 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.32 
 
 
497 aa  292  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  40.7 
 
 
459 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  39.68 
 
 
455 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  37.16 
 
 
492 aa  289  9e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  36.36 
 
 
490 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  36.38 
 
 
490 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.38 
 
 
490 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  36.36 
 
 
490 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  37.87 
 
 
487 aa  287  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  37.68 
 
 
498 aa  288  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  36.36 
 
 
490 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  36.36 
 
 
490 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  40.79 
 
 
486 aa  286  7e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  39.45 
 
 
464 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  36.24 
 
 
458 aa  283  7.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  37.16 
 
 
486 aa  281  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  34.74 
 
 
490 aa  282  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  36.95 
 
 
486 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  37.16 
 
 
486 aa  280  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  37.16 
 
 
486 aa  281  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.3 
 
 
505 aa  281  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  37.11 
 
 
488 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  37.11 
 
 
488 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  37.11 
 
 
488 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  36.95 
 
 
486 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5663  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.71 
 
 
509 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>