291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3896 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  100 
 
 		 489 aa  1000    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  67.67 
 
 		 459 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  66.81 
 
 		 464 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  67.1 
 
 		 455 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  61.73 
 
 		 478 aa  557  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  49.9 
 
 		 492 aa  478  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  54.25 
 
 		 493 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  50.84 
 
 		 497 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  48.25 
 
 		 493 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  50.76 
 
 		 486 aa  425  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  49.46 
 
 		 487 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  47.26 
 
 		 490 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  47.05 
 
 		 490 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  47.26 
 
 		 490 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  47.05 
 
 		 490 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  47.26 
 
 		 490 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  47.12 
 
 		 488 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  46.82 
 
 		 486 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  47.12 
 
 		 488 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.61 
 
 		 486 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  47.12 
 
 		 488 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  47.33 
 
 		 488 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47.12 
 
 		 488 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  46.82 
 
 		 486 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  47.12 
 
 		 488 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  47.33 
 
 		 488 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  46.4 
 
 		 486 aa  414  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  46.4 
 
 		 486 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  48.58 
 
 		 488 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  46.4 
 
 		 486 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  46.4 
 
 		 486 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  48.8 
 
 		 488 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  47.53 
 
 		 497 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  47.12 
 
 		 488 aa  415  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  48.58 
 
 		 488 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  46.48 
 
 		 486 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  47.08 
 
 		 486 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  47.08 
 
 		 486 aa  411  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  48.58 
 
 		 488 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  48.18 
 
 		 490 aa  411  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.88 
 
 		 488 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.38 
 
 		 495 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  43.67 
 
 		 487 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  47.55 
 
 		 498 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  47.08 
 
 		 486 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.61 
 
 		 493 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  48.58 
 
 		 488 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.19 
 
 		 495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  46.87 
 
 		 486 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  46.2 
 
 		 488 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  46.65 
 
 		 486 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.87 
 
 		 486 aa  405  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.32 
 
 		 488 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  46.79 
 
 		 490 aa  405  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.79 
 
 		 490 aa  405  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  46.65 
 
 		 486 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  46.44 
 
 		 486 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.07 
 
 		 490 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  49.25 
 
 		 496 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.44 
 
 		 486 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.72 
 
 		 490 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.17 
 
 		 505 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  47.95 
 
 		 492 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  42.58 
 
 		 490 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  46.68 
 
 		 510 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  42.68 
 
 		 491 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.33 
 
 		 528 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.17 
 
 		 485 aa  365  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  43.01 
 
 		 497 aa  363  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.23 
 
 		 493 aa  361  2e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  47.61 
 
 		 452 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.29 
 
 		 491 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  43.55 
 
 		 491 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.46 
 
 		 497 aa  355  6.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.58 
 
 		 506 aa  352  7e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  40.87 
 
 		 491 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.92 
 
 		 509 aa  348  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  40.99 
 
 		 493 aa  346  5e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  42.15 
 
 		 490 aa  346  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  44.9 
 
 		 451 aa  343  4e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  39.02 
 
 		 502 aa  343  5e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  40.22 
 
 		 493 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  40.9 
 
 		 499 aa  342  1e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  42.4 
 
 		 484 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.91 
 
 		 494 aa  340  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  41.16 
 
 		 520 aa  339  5e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  42.06 
 
 		 497 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  38.96 
 
 		 500 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  43.4 
 
 		 485 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1886  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.11 
 
 		 485 aa  334  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.884338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  42.48 
 
 		 485 aa  334  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  40.38 
 
 		 490 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  40.38 
 
 		 490 aa  333  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  40.6 
 
 		 490 aa  333  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  40.38 
 
 		 490 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  39.83 
 
 		 491 aa  329  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.83 
 
 		 492 aa  319  6e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  42.22 
 
 		 458 aa  318  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4096  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.23 
 
 		 488 aa  317  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  40.92 
 
 		 503 aa  317  3e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>