293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1039 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  64.63 
 
 
486 aa  648    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  65.05 
 
 
486 aa  655    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  64.63 
 
 
486 aa  648    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  64.63 
 
 
486 aa  648    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  64.84 
 
 
486 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  64.63 
 
 
486 aa  647    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  65.47 
 
 
488 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  65.68 
 
 
488 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  100 
 
 
488 aa  1009    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  93.6 
 
 
488 aa  929    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  73.79 
 
 
490 aa  728    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  65.05 
 
 
486 aa  656    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  65.05 
 
 
486 aa  652    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  65.47 
 
 
488 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  65.26 
 
 
488 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  64.84 
 
 
486 aa  651    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  73.81 
 
 
490 aa  726    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  65.05 
 
 
487 aa  654    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  65.5 
 
 
490 aa  649    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  65.68 
 
 
488 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  59.29 
 
 
493 aa  593  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  58.37 
 
 
490 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  58.37 
 
 
490 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  57.41 
 
 
497 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  57.62 
 
 
498 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  55.53 
 
 
488 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  55.74 
 
 
488 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  55.74 
 
 
488 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  55.53 
 
 
488 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  55.53 
 
 
488 aa  560  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  55.53 
 
 
488 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  55.53 
 
 
488 aa  561  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  55.53 
 
 
488 aa  561  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  55.35 
 
 
495 aa  555  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  54.51 
 
 
488 aa  556  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  55.14 
 
 
495 aa  554  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  53.89 
 
 
487 aa  535  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  53.78 
 
 
486 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  53.78 
 
 
486 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  53.99 
 
 
486 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  53.78 
 
 
486 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  53.57 
 
 
486 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  53.78 
 
 
486 aa  514  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  53.93 
 
 
490 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  53.57 
 
 
486 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  53.93 
 
 
490 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  58.53 
 
 
452 aa  513  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  53.57 
 
 
486 aa  511  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  53.72 
 
 
490 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  53.51 
 
 
490 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  53.72 
 
 
490 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  49.25 
 
 
490 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  49.25 
 
 
490 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  49.25 
 
 
490 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  49.25 
 
 
490 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  48.73 
 
 
493 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0789  mannitol dehydrogenase family protein  56.27 
 
 
358 aa  421  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000484963  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  46.5 
 
 
490 aa  421  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47.33 
 
 
486 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  43.55 
 
 
492 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  46.39 
 
 
497 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  45.32 
 
 
489 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  45.27 
 
 
493 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  50.12 
 
 
464 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  48.04 
 
 
459 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  49.42 
 
 
455 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  44.21 
 
 
485 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.33 
 
 
497 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  43.91 
 
 
492 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  41.07 
 
 
490 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  45.35 
 
 
496 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.88 
 
 
505 aa  353  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  40.61 
 
 
491 aa  353  5e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.52 
 
 
494 aa  351  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  38.65 
 
 
493 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  43.82 
 
 
510 aa  350  3e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  42.22 
 
 
484 aa  350  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  38.11 
 
 
493 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  40.2 
 
 
491 aa  347  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  42.77 
 
 
485 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  38.93 
 
 
497 aa  343  5.999999999999999e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  40.2 
 
 
491 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  40.37 
 
 
497 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  38.62 
 
 
491 aa  338  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.29 
 
 
491 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  42.69 
 
 
471 aa  333  3e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  42.32 
 
 
478 aa  333  4e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.58 
 
 
493 aa  333  4e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  41.27 
 
 
489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.76 
 
 
505 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  41.27 
 
 
489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  41.27 
 
 
489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  41.27 
 
 
489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  41.27 
 
 
489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  41.27 
 
 
489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  41.27 
 
 
498 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  40.62 
 
 
491 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.62 
 
 
487 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.79 
 
 
509 aa  325  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.26 
 
 
492 aa  323  4e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>