291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2353 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  69.57 
 
 
495 aa  710    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3748  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  73.02 
 
 
493 aa  744    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29715  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
494 aa  1005    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3446  Mannitol dehydrogenase domain  72.62 
 
 
493 aa  743    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2459  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  71.75 
 
 
589 aa  739    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  73.57 
 
 
659 aa  748    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3848  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  62.47 
 
 
494 aa  612  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.611991  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4177  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  60.57 
 
 
487 aa  555  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25233  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1732  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.63 
 
 
477 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163277  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0096  mannitol dehydrogenase  57.45 
 
 
477 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.027752  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1685  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  56.05 
 
 
477 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  48.25 
 
 
497 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  45.64 
 
 
497 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0426  mannitol dehydrogenase-like  49.28 
 
 
492 aa  434  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.321146 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  47.25 
 
 
505 aa  433  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0969  mannitol dehydrogenase domain protein  49.47 
 
 
499 aa  429  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.124507 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2907  mannitol dehydrogenase-like  48.35 
 
 
499 aa  421  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.24 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  47.91 
 
 
503 aa  405  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  44.88 
 
 
491 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.79 
 
 
492 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  45.51 
 
 
491 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.85 
 
 
506 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  44.9 
 
 
490 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3962  Mannitol dehydrogenase domain protein  49.46 
 
 
488 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25102  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  43.72 
 
 
493 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  44.42 
 
 
497 aa  385  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  43.78 
 
 
493 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.03 
 
 
491 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  43.24 
 
 
491 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  43.33 
 
 
499 aa  375  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  43.03 
 
 
491 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.95 
 
 
528 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  39.12 
 
 
500 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4739  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.02 
 
 
472 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0950062  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  42.53 
 
 
520 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  39.82 
 
 
484 aa  368  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  43.8 
 
 
472 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.8 
 
 
472 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0634883 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  39.64 
 
 
502 aa  364  2e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.65 
 
 
486 aa  336  7e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  38.7 
 
 
493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.84 
 
 
493 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  37.22 
 
 
497 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  41.65 
 
 
496 aa  310  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  38.2 
 
 
492 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  37.23 
 
 
488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  38.22 
 
 
486 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  38.22 
 
 
486 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  37.79 
 
 
488 aa  306  8.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  38.22 
 
 
486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  38.22 
 
 
486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  38.22 
 
 
486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  38.22 
 
 
486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3090  Mannitol dehydrogenase domain  41.71 
 
 
506 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  38.22 
 
 
486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  37.02 
 
 
488 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  38 
 
 
486 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5663  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.03 
 
 
509 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3727  mannitol dehydrogenase Rossman-like  39.24 
 
 
509 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  37.08 
 
 
488 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4641  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.24 
 
 
509 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  36.81 
 
 
488 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.81 
 
 
488 aa  302  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  37.37 
 
 
490 aa  302  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.81 
 
 
488 aa  302  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  36.81 
 
 
488 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  36.81 
 
 
488 aa  302  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.13 
 
 
505 aa  302  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.31 
 
 
495 aa  301  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.49 
 
 
495 aa  300  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.97 
 
 
497 aa  298  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  37.42 
 
 
490 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  37.42 
 
 
490 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  37.42 
 
 
490 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  37.42 
 
 
490 aa  297  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  37.42 
 
 
490 aa  297  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.08 
 
 
493 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  40.18 
 
 
498 aa  295  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  38.17 
 
 
486 aa  294  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  36.59 
 
 
486 aa  294  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  36.59 
 
 
486 aa  293  5e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  36.38 
 
 
486 aa  292  8e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  36.38 
 
 
488 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  41.3 
 
 
455 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  36.38 
 
 
486 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  36.38 
 
 
488 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  36.52 
 
 
490 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  36.38 
 
 
488 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  36.38 
 
 
486 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  36.76 
 
 
490 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  36.54 
 
 
490 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  36.76 
 
 
490 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  36.44 
 
 
488 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.38 
 
 
486 aa  289  7e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.17 
 
 
486 aa  289  8e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  41.07 
 
 
464 aa  289  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  34.53 
 
 
490 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  36.23 
 
 
490 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.23 
 
 
490 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>