288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2436 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  91.63 
 
 		 493 aa  942    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  100 
 
 		 493 aa  1022    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  80.2 
 
 		 490 aa  814    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  70.41 
 
 		 491 aa  720    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  68.37 
 
 		 491 aa  699    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  68.98 
 
 		 491 aa  691    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  64.49 
 
 		 491 aa  656    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  75.92 
 
 		 491 aa  758    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  47.66 
 
 		 497 aa  474  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  47.65 
 
 		 494 aa  459  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  46.91 
 
 		 497 aa  458  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  48.07 
 
 		 503 aa  449  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.34 
 
 		 506 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.06 
 
 		 492 aa  433  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  44.9 
 
 		 497 aa  433  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  45.51 
 
 		 500 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.4 
 
 		 505 aa  421  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  43.09 
 
 		 502 aa  400  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  41.72 
 
 		 484 aa  400  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  43.06 
 
 		 497 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3962  Mannitol dehydrogenase domain protein  47.25 
 
 		 488 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25102  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4739  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.7 
 
 		 472 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0950062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.72 
 
 		 494 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  43.29 
 
 		 472 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  43.87 
 
 		 520 aa  388  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.29 
 
 		 472 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0634883 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.09 
 
 		 659 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  44.49 
 
 		 486 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.01 
 
 		 528 aa  381  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  41.31 
 
 		 495 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3446  Mannitol dehydrogenase domain  43.58 
 
 		 493 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3848  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.19 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.611991  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.65 
 
 		 486 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3748  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  43.81 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  42.16 
 
 		 499 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2459  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.42 
 
 		 589 aa  375  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  38.26 
 
 		 492 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  40.24 
 
 		 490 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  39.23 
 
 		 493 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3090  Mannitol dehydrogenase domain  43.47 
 
 		 506 aa  360  3e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3727  mannitol dehydrogenase Rossman-like  44.65 
 
 		 509 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5663  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.42 
 
 		 509 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733675 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4641  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.65 
 
 		 509 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  39.68 
 
 		 498 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.71 
 
 		 493 aa  356  5.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  40.16 
 
 		 490 aa  356  5.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.75 
 
 		 493 aa  354  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  40.46 
 
 		 492 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1732  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.19 
 
 		 477 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0096  mannitol dehydrogenase  42.11 
 
 		 477 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.027752  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.41 
 
 		 490 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  40.41 
 
 		 490 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.12 
 
 		 505 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1685  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.56 
 
 		 477 aa  349  7e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.49 
 
 		 488 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  39.58 
 
 		 488 aa  347  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.63 
 
 		 495 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.11 
 
 		 488 aa  347  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  40.39 
 
 		 486 aa  347  3e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  40.39 
 
 		 486 aa  347  4e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  40.39 
 
 		 486 aa  347  4e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  39.96 
 
 		 488 aa  346  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.96 
 
 		 488 aa  346  5e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  39.58 
 
 		 488 aa  346  5e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  39.96 
 
 		 488 aa  346  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.96 
 
 		 488 aa  346  5e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  39.96 
 
 		 488 aa  346  5e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  40.39 
 
 		 486 aa  346  6e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.17 
 
 		 486 aa  345  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.92 
 
 		 497 aa  345  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  40.17 
 
 		 486 aa  345  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  40.39 
 
 		 486 aa  345  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  40.17 
 
 		 486 aa  345  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  38.97 
 
 		 487 aa  344  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  38.87 
 
 		 488 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.05 
 
 		 509 aa  344  2.9999999999999997e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  41.09 
 
 		 496 aa  343  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  40.22 
 
 		 489 aa  342  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  40 
 
 		 490 aa  342  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.09 
 
 		 495 aa  342  8e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2907  mannitol dehydrogenase-like  41.14 
 
 		 499 aa  341  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554349 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  40 
 
 		 490 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  40.2 
 
 		 490 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  40 
 
 		 490 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  39.8 
 
 		 490 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.47 
 
 		 490 aa  340  5e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  38.46 
 
 		 488 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  38.67 
 
 		 488 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  38.25 
 
 		 488 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.35 
 
 		 497 aa  336  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.54 
 
 		 490 aa  336  5.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  38.05 
 
 		 488 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  38.25 
 
 		 488 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4177  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.33 
 
 		 487 aa  335  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  39.3 
 
 		 488 aa  333  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  39.01 
 
 		 486 aa  333  6e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  38.81 
 
 		 486 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.73 
 
 		 486 aa  329  6e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  38.6 
 
 		 486 aa  329  7e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  38.6 
 
 		 486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>