293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3239 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  64.67 
 
 
495 aa  664    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  63.37 
 
 
488 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  63.58 
 
 
488 aa  642    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  63.37 
 
 
488 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  72.58 
 
 
490 aa  724    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  63.37 
 
 
488 aa  640    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  63.79 
 
 
488 aa  644    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  63.43 
 
 
495 aa  657    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  63.37 
 
 
488 aa  641    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
493 aa  1009    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  72.58 
 
 
490 aa  724    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  66.87 
 
 
498 aa  684    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  63.79 
 
 
488 aa  641    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  63.58 
 
 
488 aa  642    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  68.26 
 
 
497 aa  697    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  64.05 
 
 
488 aa  655    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  70.69 
 
 
452 aa  608  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  59.92 
 
 
487 aa  603  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  59.38 
 
 
488 aa  591  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  59.29 
 
 
488 aa  593  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  58.68 
 
 
486 aa  591  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  58.26 
 
 
486 aa  585  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  58.26 
 
 
486 aa  585  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  58.47 
 
 
486 aa  587  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  58.26 
 
 
486 aa  586  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  58.47 
 
 
486 aa  585  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  58.06 
 
 
486 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  58.06 
 
 
486 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  58.06 
 
 
486 aa  580  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  59.96 
 
 
488 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  59.96 
 
 
488 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  59.53 
 
 
488 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  56.91 
 
 
487 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  58.28 
 
 
490 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  59.75 
 
 
488 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  59.75 
 
 
488 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  58.93 
 
 
486 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  58.93 
 
 
486 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  58.93 
 
 
486 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  58.93 
 
 
486 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  58.7 
 
 
490 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  58.52 
 
 
486 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  58.73 
 
 
486 aa  571  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  58.52 
 
 
486 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  58.73 
 
 
486 aa  568  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.44 
 
 
490 aa  564  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  58.07 
 
 
490 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  58.07 
 
 
490 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  57.86 
 
 
490 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  57.86 
 
 
490 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  57.65 
 
 
490 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0789  mannitol dehydrogenase family protein  66.95 
 
 
358 aa  500  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000484963  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  45.14 
 
 
492 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  46.93 
 
 
490 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  46.93 
 
 
490 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  46.72 
 
 
490 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  46.93 
 
 
490 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  49.26 
 
 
493 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  46.14 
 
 
490 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  48.75 
 
 
486 aa  415  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  46.61 
 
 
489 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  46.47 
 
 
497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  48.05 
 
 
496 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  48.05 
 
 
459 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  47 
 
 
464 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  45.93 
 
 
493 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  46.78 
 
 
455 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  47.02 
 
 
478 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  45.91 
 
 
485 aa  381  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  44.23 
 
 
490 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  43.04 
 
 
491 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.32 
 
 
494 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  44.83 
 
 
484 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.66 
 
 
493 aa  365  1e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  43.12 
 
 
491 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  45.38 
 
 
485 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  42.32 
 
 
491 aa  363  4e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  45.06 
 
 
492 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  40.71 
 
 
493 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.91 
 
 
505 aa  356  6.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  42.74 
 
 
497 aa  355  7.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.81 
 
 
497 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  45.38 
 
 
510 aa  352  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  41.61 
 
 
491 aa  349  8e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  40.62 
 
 
493 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5060  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.12 
 
 
483 aa  346  6e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.04 
 
 
491 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  45.96 
 
 
489 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  45.96 
 
 
489 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  45.96 
 
 
489 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  45.96 
 
 
489 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  45.96 
 
 
489 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  45.96 
 
 
489 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  45.96 
 
 
498 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  39.92 
 
 
497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  44 
 
 
491 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.64 
 
 
487 aa  335  9e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3741  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  65.27 
 
 
263 aa  334  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  39.71 
 
 
497 aa  333  5e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.37 
 
 
509 aa  332  7.000000000000001e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>