291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01746 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  100 
 
 
484 aa  1005    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  55.63 
 
 
500 aa  557  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  52.44 
 
 
506 aa  519  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  49.89 
 
 
492 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  50 
 
 
497 aa  466  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  48.46 
 
 
505 aa  455  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  47.41 
 
 
497 aa  455  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  46.93 
 
 
497 aa  435  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  45.37 
 
 
491 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.04 
 
 
494 aa  423  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  44.44 
 
 
503 aa  413  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  43.43 
 
 
491 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4739  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.52 
 
 
472 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0950062  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  43.74 
 
 
472 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.74 
 
 
472 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0634883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.56 
 
 
491 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  44.97 
 
 
491 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  42.98 
 
 
493 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  41.72 
 
 
493 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.68 
 
 
528 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  43.22 
 
 
491 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  44.27 
 
 
490 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  42.23 
 
 
499 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  42.83 
 
 
502 aa  382  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3962  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.86 
 
 
488 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25102  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.01 
 
 
659 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  41.55 
 
 
495 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.82 
 
 
494 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  40.55 
 
 
520 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3748  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  40.79 
 
 
493 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29715  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0096  mannitol dehydrogenase  40.57 
 
 
477 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.027752  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1732  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.57 
 
 
477 aa  363  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163277  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3446  Mannitol dehydrogenase domain  40.79 
 
 
493 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2459  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.91 
 
 
589 aa  362  8e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  38.94 
 
 
493 aa  362  8e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3848  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.4 
 
 
494 aa  359  7e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.611991  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  45.36 
 
 
486 aa  355  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.86 
 
 
493 aa  353  5e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1685  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.58 
 
 
477 aa  353  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.69 
 
 
505 aa  346  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.28 
 
 
486 aa  345  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  39.3 
 
 
497 aa  342  9e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0969  mannitol dehydrogenase domain protein  40.76 
 
 
499 aa  341  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.124507 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  37.58 
 
 
492 aa  340  4e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0426  mannitol dehydrogenase-like  40.32 
 
 
492 aa  340  4e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.321146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  39.91 
 
 
496 aa  338  9e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  40.55 
 
 
488 aa  330  3e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3090  Mannitol dehydrogenase domain  42.71 
 
 
506 aa  330  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0308639 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  40.32 
 
 
488 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  40.22 
 
 
486 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.32 
 
 
488 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  40.32 
 
 
488 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4177  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.85 
 
 
487 aa  328  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25233  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  40.32 
 
 
488 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.32 
 
 
488 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  40.32 
 
 
488 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  40.22 
 
 
486 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  40.09 
 
 
488 aa  327  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  40 
 
 
486 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  39.78 
 
 
486 aa  325  8.000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  39.78 
 
 
486 aa  325  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  39.78 
 
 
486 aa  325  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  39.78 
 
 
486 aa  325  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5663  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.67 
 
 
509 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733675 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  39.57 
 
 
486 aa  324  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  38.17 
 
 
492 aa  324  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3727  mannitol dehydrogenase Rossman-like  41.67 
 
 
509 aa  323  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4641  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.67 
 
 
509 aa  323  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  36.38 
 
 
458 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2907  mannitol dehydrogenase-like  37.36 
 
 
499 aa  321  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554349 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  39.13 
 
 
487 aa  321  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  40.05 
 
 
455 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  39.45 
 
 
490 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  39.82 
 
 
464 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  39.02 
 
 
490 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  39.02 
 
 
490 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  38.72 
 
 
486 aa  316  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  39.23 
 
 
490 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  39.23 
 
 
490 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  38.38 
 
 
486 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  38.18 
 
 
488 aa  314  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  38.5 
 
 
486 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  38.8 
 
 
459 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.81 
 
 
488 aa  312  6.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.32 
 
 
486 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  37.22 
 
 
487 aa  311  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.81 
 
 
509 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  38.5 
 
 
486 aa  311  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  36.15 
 
 
490 aa  311  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  37.64 
 
 
485 aa  311  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.27 
 
 
486 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  37 
 
 
490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  38.27 
 
 
486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.74 
 
 
488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  38.27 
 
 
486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  37.69 
 
 
489 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  38.27 
 
 
486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.95 
 
 
485 aa  306  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.43 
 
 
495 aa  306  6e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.43 
 
 
495 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>