287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03857 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  100 
 
 
458 aa  924    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  55.66 
 
 
485 aa  488  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  50.34 
 
 
492 aa  432  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  52.47 
 
 
486 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  48.37 
 
 
493 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  49.88 
 
 
493 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  45.64 
 
 
497 aa  360  4e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  42.42 
 
 
492 aa  353  4e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  49.02 
 
 
505 aa  353  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  46.43 
 
 
492 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  46.26 
 
 
496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  46.87 
 
 
464 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  50.37 
 
 
509 aa  339  7e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  46.64 
 
 
455 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.91 
 
 
494 aa  332  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  42.11 
 
 
499 aa  329  6e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  41.03 
 
 
491 aa  325  9e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  46.17 
 
 
459 aa  325  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  36.38 
 
 
484 aa  321  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  42.67 
 
 
503 aa  320  3.9999999999999996e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  42.22 
 
 
489 aa  318  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  36.89 
 
 
500 aa  317  4e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  39.61 
 
 
491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  46.81 
 
 
510 aa  312  9e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3649  mannitol dehydrogenase Rossman-like  40.73 
 
 
485 aa  312  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0357773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.67 
 
 
491 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  40.8 
 
 
486 aa  311  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  40.8 
 
 
486 aa  310  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.76 
 
 
528 aa  310  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  40.8 
 
 
486 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  39.87 
 
 
520 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  40.8 
 
 
486 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  40.8 
 
 
486 aa  310  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  41.03 
 
 
488 aa  310  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  42.64 
 
 
490 aa  309  5e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  41.5 
 
 
497 aa  309  6.999999999999999e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  40.58 
 
 
488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.33 
 
 
505 aa  307  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.58 
 
 
486 aa  307  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  40.58 
 
 
486 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  40.58 
 
 
486 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  40.09 
 
 
488 aa  306  6e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.09 
 
 
488 aa  306  6e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.09 
 
 
488 aa  306  6e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  42.04 
 
 
490 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  40.09 
 
 
488 aa  306  6e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  40.09 
 
 
488 aa  306  6e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  42.04 
 
 
490 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  41.81 
 
 
490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.21 
 
 
497 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  41.81 
 
 
490 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.52 
 
 
488 aa  302  8.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  41.26 
 
 
488 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  42.49 
 
 
484 aa  302  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  39 
 
 
497 aa  301  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  43.42 
 
 
485 aa  301  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  41.81 
 
 
490 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  36.81 
 
 
502 aa  300  5e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.3 
 
 
506 aa  299  7e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.43 
 
 
488 aa  298  9e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.5 
 
 
490 aa  298  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  38.44 
 
 
491 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  43.22 
 
 
451 aa  297  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  38.76 
 
 
491 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  38.27 
 
 
490 aa  296  4e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  38.08 
 
 
490 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  42.32 
 
 
498 aa  295  9e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  44.16 
 
 
478 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  38.44 
 
 
490 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  37.24 
 
 
495 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.12 
 
 
490 aa  295  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  39.29 
 
 
493 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  45.41 
 
 
485 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  38.44 
 
 
490 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  38.22 
 
 
490 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  37.06 
 
 
493 aa  292  9e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.72 
 
 
493 aa  292  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1859  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.94 
 
 
470 aa  292  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3962  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.69 
 
 
488 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25102  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  43.61 
 
 
470 aa  290  4e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0969  mannitol dehydrogenase domain protein  40.68 
 
 
499 aa  290  4e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.124507 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  40.04 
 
 
488 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  40.32 
 
 
490 aa  289  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  40.04 
 
 
488 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  40.04 
 
 
488 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  39.82 
 
 
486 aa  288  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  40.04 
 
 
488 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  38.26 
 
 
490 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  39.33 
 
 
486 aa  286  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.89 
 
 
486 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  39.82 
 
 
488 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  38.89 
 
 
486 aa  285  9e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.6 
 
 
486 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.58 
 
 
659 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  39.69 
 
 
488 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  38.89 
 
 
486 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  37.75 
 
 
487 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.56 
 
 
493 aa  284  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.7 
 
 
495 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3748  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  36.24 
 
 
493 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29715  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>