287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1753 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
485 aa  973    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  55.66 
 
 
458 aa  488  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  50.21 
 
 
492 aa  464  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  53.58 
 
 
486 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  49.35 
 
 
493 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  46.01 
 
 
497 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  48.58 
 
 
493 aa  388  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  49.89 
 
 
505 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  41.98 
 
 
492 aa  364  1e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  46.17 
 
 
489 aa  365  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  44.98 
 
 
492 aa  362  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  48.28 
 
 
455 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  49.2 
 
 
459 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  48.05 
 
 
464 aa  359  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  45.58 
 
 
496 aa  356  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  44.44 
 
 
486 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  43.68 
 
 
486 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  43.68 
 
 
486 aa  353  5e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  43.68 
 
 
486 aa  353  5e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.19 
 
 
494 aa  350  3e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.2 
 
 
509 aa  350  3e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.47 
 
 
486 aa  350  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  43.47 
 
 
486 aa  349  5e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  43.47 
 
 
486 aa  349  5e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  43.47 
 
 
486 aa  349  6e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  46.22 
 
 
478 aa  344  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  42.41 
 
 
491 aa  344  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.54 
 
 
460 aa  336  5e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.54 
 
 
460 aa  336  5e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  43.84 
 
 
503 aa  332  9e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  42.95 
 
 
490 aa  328  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  42.74 
 
 
490 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  41.08 
 
 
488 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  42.74 
 
 
490 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  42.74 
 
 
490 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  41.74 
 
 
497 aa  326  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  46.44 
 
 
510 aa  325  8.000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  42.61 
 
 
499 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  42.52 
 
 
490 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  40.77 
 
 
488 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.77 
 
 
488 aa  323  3e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.77 
 
 
488 aa  324  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  40.77 
 
 
488 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  40.77 
 
 
488 aa  324  3e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  40.77 
 
 
488 aa  323  4e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.89 
 
 
505 aa  323  4e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  39.45 
 
 
490 aa  322  8e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  39.58 
 
 
491 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  41.04 
 
 
486 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  43.9 
 
 
485 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  40.9 
 
 
488 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  41.09 
 
 
486 aa  320  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  42.83 
 
 
484 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.82 
 
 
486 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  38.61 
 
 
487 aa  320  3.9999999999999996e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.77 
 
 
528 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  40.82 
 
 
486 aa  319  6e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.72 
 
 
495 aa  319  7e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.87 
 
 
491 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.59 
 
 
495 aa  319  9e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  41.83 
 
 
487 aa  319  9e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.05 
 
 
506 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  40.82 
 
 
486 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  40.21 
 
 
491 aa  317  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  40.6 
 
 
486 aa  316  6e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  40.6 
 
 
486 aa  316  6e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  41.86 
 
 
490 aa  315  8e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  40.6 
 
 
486 aa  315  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.6 
 
 
486 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.97 
 
 
497 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  41.13 
 
 
488 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  41.13 
 
 
488 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  37.5 
 
 
493 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  41.34 
 
 
488 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  41.13 
 
 
488 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  39.58 
 
 
491 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3649  mannitol dehydrogenase Rossman-like  39.27 
 
 
485 aa  310  5e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0357773  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  41.11 
 
 
488 aa  310  5e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  41.5 
 
 
451 aa  309  6.999999999999999e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  41.38 
 
 
498 aa  309  8e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.05 
 
 
490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  39.47 
 
 
497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  41.13 
 
 
488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.34 
 
 
493 aa  308  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.31 
 
 
488 aa  307  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.74 
 
 
488 aa  307  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  35.95 
 
 
484 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.35 
 
 
497 aa  306  5.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3962  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.5 
 
 
488 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25102  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3727  mannitol dehydrogenase Rossman-like  43 
 
 
509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4641  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43 
 
 
509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.38 
 
 
492 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  35.43 
 
 
500 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  41.27 
 
 
520 aa  303  3.0000000000000004e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.09 
 
 
490 aa  303  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5663  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.75 
 
 
509 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  36.4 
 
 
493 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  41.77 
 
 
485 aa  302  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05330  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  40.43 
 
 
548 aa  301  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  40.36 
 
 
470 aa  300  4e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>