291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3678 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 460 aa  940    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 460 aa  940    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  62.12 
 
 		 430 aa  491  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  53.22 
 
 		 470 aa  449  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  45.66 
 
 		 492 aa  386  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  49.54 
 
 		 493 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  48.48 
 
 		 486 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  45.85 
 
 		 497 aa  365  1e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  47.49 
 
 		 492 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1886  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  49.55 
 
 		 485 aa  355  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.884338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  49.08 
 
 		 505 aa  353  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  46.31 
 
 		 493 aa  346  5e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  49.88 
 
 		 509 aa  346  6e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.54 
 
 		 485 aa  336  3.9999999999999995e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  42.53 
 
 		 490 aa  333  4e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  45.41 
 
 		 455 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  45.18 
 
 		 464 aa  330  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  43.99 
 
 		 496 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  46.75 
 
 		 510 aa  329  5.0000000000000004e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.94 
 
 		 487 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1859  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.41 
 
 		 470 aa  319  7e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05330  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  43.92 
 
 		 548 aa  319  7.999999999999999e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  46.91 
 
 		 459 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  44.12 
 
 		 491 aa  316  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.65 
 
 		 493 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.67 
 
 		 486 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  39.45 
 
 		 490 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  40.67 
 
 		 486 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  40.67 
 
 		 486 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.48 
 
 		 497 aa  313  5.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  39.23 
 
 		 490 aa  312  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  39.23 
 
 		 490 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  39.23 
 
 		 490 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  39.23 
 
 		 490 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  40.44 
 
 		 486 aa  311  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  40.44 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  40.44 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  40.44 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  42.56 
 
 		 488 aa  311  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  42.32 
 
 		 484 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  42 
 
 		 490 aa  310  4e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  45.84 
 
 		 451 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  40.22 
 
 		 486 aa  307  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  38.56 
 
 		 520 aa  306  6e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.63 
 
 		 494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.56 
 
 		 493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.58 
 
 		 490 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  43.44 
 
 		 489 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  43.91 
 
 		 498 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  40.91 
 
 		 499 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  43.44 
 
 		 489 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  43.44 
 
 		 489 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  43.44 
 
 		 489 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  43.44 
 
 		 489 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  43.44 
 
 		 489 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  41.74 
 
 		 497 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.36 
 
 		 493 aa  303  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  43.05 
 
 		 485 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  40.47 
 
 		 488 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  40.47 
 
 		 488 aa  300  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.47 
 
 		 488 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.47 
 
 		 488 aa  300  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  40.47 
 
 		 488 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  40.72 
 
 		 489 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  40.37 
 
 		 488 aa  300  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  40.7 
 
 		 488 aa  300  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  40.7 
 
 		 488 aa  300  5e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.61 
 
 		 495 aa  300  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.61 
 
 		 495 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  40.84 
 
 		 487 aa  296  7e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  42.75 
 
 		 486 aa  294  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  41.46 
 
 		 491 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  40.5 
 
 		 498 aa  293  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.75 
 
 		 486 aa  293  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  37.71 
 
 		 492 aa  292  7e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  42.75 
 
 		 486 aa  292  8e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  42.75 
 
 		 486 aa  292  9e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  43.61 
 
 		 503 aa  292  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3014  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.8 
 
 		 501 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.264666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5060  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.26 
 
 		 483 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.87 
 
 		 490 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  42.51 
 
 		 486 aa  290  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  39.87 
 
 		 490 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  42.51 
 
 		 486 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  42.51 
 
 		 486 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.33 
 
 		 490 aa  290  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39 
 
 		 497 aa  289  8e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  39.14 
 
 		 491 aa  289  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  37.76 
 
 		 487 aa  289  9e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  42.2 
 
 		 488 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3280  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.03 
 
 		 484 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  42.27 
 
 		 486 aa  287  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2666  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.09 
 
 		 499 aa  287  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  42.75 
 
 		 488 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39 
 
 		 491 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  40.83 
 
 		 488 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  41.06 
 
 		 488 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  39.59 
 
 		 491 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  42.2 
 
 		 488 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.27 
 
 		 486 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>