291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5134 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  75.31 
 
 
489 aa  692    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  75.52 
 
 
498 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  100 
 
 
491 aa  968    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  96.3 
 
 
487 aa  893    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  75.31 
 
 
489 aa  692    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  75.31 
 
 
489 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  75.52 
 
 
489 aa  693    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  75.52 
 
 
489 aa  693    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  75.31 
 
 
489 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  49.27 
 
 
493 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  48.5 
 
 
492 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  43.53 
 
 
492 aa  378  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  47.14 
 
 
497 aa  363  3e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.22 
 
 
493 aa  359  8e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  48.78 
 
 
510 aa  352  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  43.42 
 
 
498 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.96 
 
 
497 aa  347  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44 
 
 
493 aa  346  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  48.38 
 
 
505 aa  344  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.69 
 
 
495 aa  344  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47.96 
 
 
486 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.69 
 
 
495 aa  342  5.999999999999999e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  40.17 
 
 
487 aa  342  1e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  43.13 
 
 
490 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.13 
 
 
490 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  41.05 
 
 
490 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  42.45 
 
 
490 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.27 
 
 
490 aa  336  5.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  45.83 
 
 
496 aa  333  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  41.7 
 
 
488 aa  332  8e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  44.79 
 
 
470 aa  332  9e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  41.49 
 
 
488 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.49 
 
 
488 aa  332  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  41.49 
 
 
488 aa  332  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  41.49 
 
 
488 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.49 
 
 
488 aa  332  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  41.49 
 
 
488 aa  331  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.98 
 
 
486 aa  331  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  41.74 
 
 
488 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.62 
 
 
488 aa  330  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  41.74 
 
 
488 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  41.7 
 
 
488 aa  329  6e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  41.53 
 
 
488 aa  329  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  40.55 
 
 
486 aa  329  8e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.69 
 
 
486 aa  329  9e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  42.69 
 
 
486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  42.69 
 
 
486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  43.27 
 
 
490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  40.55 
 
 
486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  42.47 
 
 
486 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  42.69 
 
 
486 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  40.34 
 
 
486 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  42.47 
 
 
486 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  40.55 
 
 
486 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  40.67 
 
 
487 aa  327  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  42.63 
 
 
486 aa  327  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  44.92 
 
 
464 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  41.53 
 
 
488 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  42.47 
 
 
486 aa  327  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  43.27 
 
 
490 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  41.31 
 
 
488 aa  326  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.34 
 
 
486 aa  326  5e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  40.34 
 
 
486 aa  326  5e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  44.8 
 
 
455 aa  326  6e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  43.05 
 
 
490 aa  326  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47 
 
 
509 aa  325  8.000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  43.05 
 
 
490 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  43.05 
 
 
490 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  40.13 
 
 
486 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  40.13 
 
 
486 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  42.79 
 
 
490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  42.79 
 
 
490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  42.79 
 
 
490 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  42.55 
 
 
490 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.81 
 
 
488 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  42.48 
 
 
488 aa  319  7.999999999999999e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5060  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47.21 
 
 
483 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  42.33 
 
 
489 aa  315  9e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.12 
 
 
460 aa  315  9e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.12 
 
 
460 aa  315  9e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1886  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.95 
 
 
485 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.884338  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.02 
 
 
490 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  44.57 
 
 
451 aa  310  5e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.74 
 
 
497 aa  309  6.999999999999999e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.41 
 
 
493 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.83 
 
 
485 aa  306  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  37.18 
 
 
490 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.05 
 
 
528 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3280  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.17 
 
 
484 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.59 
 
 
506 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  44.61 
 
 
430 aa  303  6.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  43.01 
 
 
459 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4096  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.07 
 
 
488 aa  301  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  40.05 
 
 
499 aa  299  9e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  36.82 
 
 
500 aa  298  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  42.4 
 
 
484 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  40.59 
 
 
491 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  40.04 
 
 
491 aa  294  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  40.37 
 
 
491 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  43.12 
 
 
478 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>