287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1859 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1859  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
470 aa  908    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  51.33 
 
 
493 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  47.76 
 
 
497 aa  364  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47.07 
 
 
486 aa  355  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  52.5 
 
 
509 aa  341  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  47.49 
 
 
493 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  51.23 
 
 
505 aa  329  5.0000000000000004e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  47.96 
 
 
492 aa  323  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  42.54 
 
 
492 aa  320  5e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.41 
 
 
460 aa  319  7e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.41 
 
 
460 aa  319  7e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  45.2 
 
 
455 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  44.84 
 
 
464 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  46.97 
 
 
459 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  46.67 
 
 
484 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  40.55 
 
 
490 aa  301  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  42.04 
 
 
491 aa  299  7e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5060  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  48.13 
 
 
483 aa  299  7e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  45.32 
 
 
496 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  43.63 
 
 
499 aa  296  7e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  43.63 
 
 
489 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.15 
 
 
487 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1886  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  49.64 
 
 
485 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.884338  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47.54 
 
 
493 aa  294  3e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  42.26 
 
 
497 aa  293  6e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  46.94 
 
 
458 aa  292  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  44.82 
 
 
491 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  41.29 
 
 
520 aa  289  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  42.96 
 
 
470 aa  288  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  39.36 
 
 
500 aa  288  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.91 
 
 
497 aa  287  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  43.88 
 
 
430 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  45.75 
 
 
498 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  45.75 
 
 
489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  45.75 
 
 
489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.83 
 
 
495 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  45.75 
 
 
489 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  43.91 
 
 
485 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  45.75 
 
 
489 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  45.75 
 
 
489 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  45.75 
 
 
489 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.71 
 
 
486 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  39.47 
 
 
486 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  39.47 
 
 
486 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.55 
 
 
492 aa  284  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  39.71 
 
 
486 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  39.47 
 
 
486 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  39.71 
 
 
486 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  37.64 
 
 
484 aa  283  5.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  39.23 
 
 
486 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  38.97 
 
 
493 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.69 
 
 
506 aa  282  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.43 
 
 
495 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.62 
 
 
485 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  41.56 
 
 
488 aa  281  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  42.93 
 
 
491 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.94 
 
 
490 aa  280  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  39.23 
 
 
486 aa  280  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  46.52 
 
 
510 aa  279  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  40.43 
 
 
488 aa  279  9e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  40.43 
 
 
488 aa  279  9e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.43 
 
 
488 aa  279  9e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  41.43 
 
 
488 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  40.43 
 
 
488 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.43 
 
 
488 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  40.43 
 
 
488 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  41.94 
 
 
490 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.16 
 
 
491 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.94 
 
 
490 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.73 
 
 
494 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  39.38 
 
 
490 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  43.16 
 
 
488 aa  276  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  39.38 
 
 
490 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  44.56 
 
 
478 aa  276  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  40.91 
 
 
497 aa  276  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  39.38 
 
 
490 aa  276  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  43.8 
 
 
451 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  38.53 
 
 
493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  39.38 
 
 
490 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  39.38 
 
 
490 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  45.15 
 
 
503 aa  274  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  42.47 
 
 
491 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4096  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.9 
 
 
488 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3962  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.79 
 
 
488 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25102  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.8 
 
 
494 aa  272  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  41.61 
 
 
490 aa  272  9e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.08 
 
 
528 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  42.18 
 
 
498 aa  270  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3649  mannitol dehydrogenase Rossman-like  38.83 
 
 
485 aa  270  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0357773  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.72 
 
 
493 aa  269  8.999999999999999e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  43.69 
 
 
485 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  40.7 
 
 
497 aa  269  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  36.26 
 
 
490 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.94 
 
 
505 aa  268  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  40 
 
 
497 aa  266  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  39.84 
 
 
487 aa  265  8.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  39.76 
 
 
486 aa  265  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  40 
 
 
486 aa  264  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  42.48 
 
 
491 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  39.55 
 
 
492 aa  263  6e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>