294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3047 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  100 
 
 
430 aa  858    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  62.12 
 
 
460 aa  506  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  62.12 
 
 
460 aa  506  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  53.78 
 
 
470 aa  441  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  46.98 
 
 
492 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  51.64 
 
 
493 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  51.44 
 
 
492 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  52.24 
 
 
510 aa  358  9e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05330  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  48.22 
 
 
548 aa  352  7e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1886  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  51.46 
 
 
485 aa  345  6e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.884338  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  48.95 
 
 
486 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  43.72 
 
 
497 aa  343  4e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  49.88 
 
 
505 aa  342  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  42.89 
 
 
490 aa  340  4e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  47.31 
 
 
493 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  49.4 
 
 
509 aa  316  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  45.43 
 
 
484 aa  315  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  46.38 
 
 
451 aa  312  6.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  44.61 
 
 
491 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.32 
 
 
493 aa  310  4e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.17 
 
 
485 aa  308  9e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  46.08 
 
 
455 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  45.83 
 
 
464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  40.18 
 
 
486 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.64 
 
 
494 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  42.58 
 
 
486 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  40.62 
 
 
486 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  40.18 
 
 
486 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  43.76 
 
 
498 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  40.18 
 
 
486 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  43.76 
 
 
489 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  43.76 
 
 
489 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3014  Mannitol dehydrogenase domain protein  48 
 
 
501 aa  302  7.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.264666  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  44.58 
 
 
490 aa  302  7.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.39 
 
 
487 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  43.54 
 
 
489 aa  302  9e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  43.54 
 
 
489 aa  302  9e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  43.54 
 
 
489 aa  302  9e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  43.54 
 
 
489 aa  302  9e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  42.58 
 
 
486 aa  300  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.96 
 
 
486 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  39.96 
 
 
486 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  42.34 
 
 
486 aa  300  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  39.96 
 
 
486 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  42.28 
 
 
487 aa  300  5e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  39.96 
 
 
486 aa  299  5e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.25 
 
 
493 aa  299  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.11 
 
 
486 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1859  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.88 
 
 
470 aa  298  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  42.34 
 
 
486 aa  297  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  41.53 
 
 
488 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  42.11 
 
 
486 aa  297  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.34 
 
 
486 aa  296  4e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  42.79 
 
 
488 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  46.21 
 
 
459 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  42.14 
 
 
498 aa  296  5e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  42.11 
 
 
486 aa  296  6e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.94 
 
 
495 aa  296  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  44.3 
 
 
485 aa  296  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  42.11 
 
 
486 aa  296  6e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  42.79 
 
 
488 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  42.79 
 
 
488 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  42.79 
 
 
488 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  42.79 
 
 
488 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  44.44 
 
 
496 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.69 
 
 
493 aa  293  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  40.37 
 
 
488 aa  293  5e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.37 
 
 
488 aa  293  5e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.13 
 
 
490 aa  293  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  40.37 
 
 
488 aa  293  5e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3280  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.5 
 
 
484 aa  293  6e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.37 
 
 
488 aa  292  6e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  40.37 
 
 
488 aa  292  6e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.86 
 
 
490 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  39.86 
 
 
490 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.15 
 
 
497 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.33 
 
 
495 aa  290  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  40.14 
 
 
488 aa  289  6e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.26 
 
 
488 aa  288  9e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  43.17 
 
 
489 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  39.9 
 
 
497 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  40.14 
 
 
488 aa  286  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  40.14 
 
 
488 aa  286  7e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  41.65 
 
 
490 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  41.65 
 
 
490 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  41.65 
 
 
490 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  41.65 
 
 
490 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.61 
 
 
488 aa  285  9e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  41.31 
 
 
499 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  41.65 
 
 
490 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  38.29 
 
 
500 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.66 
 
 
497 aa  283  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2666  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.36 
 
 
499 aa  283  6.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  41.86 
 
 
478 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  38.22 
 
 
487 aa  281  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5060  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.47 
 
 
483 aa  280  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  38.08 
 
 
520 aa  279  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.95 
 
 
505 aa  279  8e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  41.31 
 
 
503 aa  278  9e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  38.85 
 
 
497 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>