289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1886 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1886  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 485 aa  944    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.884338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  50.23 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  50.23 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  48.79 
 
 		 470 aa  359  5e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  51.46 
 
 		 430 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  47.13 
 
 		 493 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  44.33 
 
 		 489 aa  353  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  42.86 
 
 		 497 aa  353  5e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  40.17 
 
 		 492 aa  345  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  45.42 
 
 		 493 aa  342  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.95 
 
 		 486 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  47.49 
 
 		 464 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  47.49 
 
 		 455 aa  339  5e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  48.07 
 
 		 492 aa  339  5e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  45.49 
 
 		 459 aa  333  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.7 
 
 		 487 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  46.52 
 
 		 496 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  48.42 
 
 		 491 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  48.87 
 
 		 510 aa  329  7e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  48.48 
 
 		 505 aa  322  9.000000000000001e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  38.56 
 
 		 490 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.94 
 
 		 493 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  44.42 
 
 		 489 aa  320  5e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  44.42 
 
 		 489 aa  320  5e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  44.42 
 
 		 489 aa  320  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  44.42 
 
 		 489 aa  320  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  44.21 
 
 		 498 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  44.21 
 
 		 489 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  44.21 
 
 		 489 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.81 
 
 		 497 aa  317  4e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  45.37 
 
 		 478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1859  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  49.88 
 
 		 470 aa  310  5e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  48.22 
 
 		 509 aa  308  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.39 
 
 		 493 aa  305  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3280  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.26 
 
 		 484 aa  302  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05330  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  45.44 
 
 		 548 aa  301  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  43.61 
 
 		 451 aa  301  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  40.45 
 
 		 488 aa  297  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  37.83 
 
 		 487 aa  295  8e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  40.04 
 
 		 488 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  40.04 
 
 		 488 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  40.04 
 
 		 488 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.04 
 
 		 488 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.04 
 
 		 488 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  40.04 
 
 		 488 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  40.27 
 
 		 488 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  40.21 
 
 		 491 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  38.27 
 
 		 488 aa  294  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.16 
 
 		 497 aa  293  4e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.22 
 
 		 493 aa  293  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  42.44 
 
 		 485 aa  293  5e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  39.88 
 
 		 498 aa  291  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  39.35 
 
 		 497 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  43.08 
 
 		 490 aa  291  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.18 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  39.24 
 
 		 497 aa  289  9e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.27 
 
 		 494 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.18 
 
 		 488 aa  288  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  37.81 
 
 		 490 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  40.67 
 
 		 486 aa  287  4e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  38.94 
 
 		 486 aa  286  5e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  37.81 
 
 		 490 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  38.61 
 
 		 486 aa  286  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  37.81 
 
 		 490 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.91 
 
 		 488 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  37.71 
 
 		 493 aa  286  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  40.67 
 
 		 486 aa  286  7e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  37.81 
 
 		 490 aa  286  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  38.94 
 
 		 486 aa  286  8e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  38.94 
 
 		 486 aa  286  8e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  40.45 
 
 		 486 aa  285  9e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  37.81 
 
 		 490 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  38.94 
 
 		 486 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.2 
 
 		 490 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  40.67 
 
 		 486 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.86 
 
 		 492 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.94 
 
 		 486 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.35 
 
 		 506 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  38.72 
 
 		 486 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  38.72 
 
 		 486 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.06 
 
 		 486 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.37 
 
 		 486 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  37.37 
 
 		 486 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  39.17 
 
 		 490 aa  282  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.17 
 
 		 490 aa  282  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  36.56 
 
 		 490 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  38.4 
 
 		 520 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5060  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.85 
 
 		 483 aa  282  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  37.21 
 
 		 493 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  37.39 
 
 		 490 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  36.34 
 
 		 490 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  43.01 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  36.34 
 
 		 490 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.771638 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  40.22 
 
 		 486 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  41.61 
 
 		 488 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  40.22 
 
 		 486 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3014  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.65 
 
 		 501 aa  280  5e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.264666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  41.61 
 
 		 488 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  41.61 
 
 		 488 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  42.83 
 
 		 484 aa  279  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>